RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TAS2R50P59544 299 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ATP6V0D1P61421 351 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 BTN3A2P78410 334 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 BTG2P78543 158 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 REEP5Q00765 189 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SLC7A5Q01650 507 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 RHAGQ02094 409 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CBLBQ13191 982 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TRADDQ15628 312 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 EXT1Q16394 746 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 MEP1AQ16819 746 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 FBXO48Q5FWF7 155 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CYS1Q717R9 158 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 KRT78Q8N1N4 520 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TCAIMQ8N3R3 496 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SNX31Q8N9S9 440 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ANKRD53Q8N9V6 530 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TTLQ8NG68 377 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 M1APQ8TC57 530 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 EXT2Q93063 718 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ESAMQ96AP7 390 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 RBBP8Q99708 897 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 GRHL1Q9NZI5 618 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 RNF112Q9ULX5 631 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CENPEQ02224 2701 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 A0A0G2JN53 185 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CTAGE15A4D2H0 777 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 FAM159BA6NKW6 160 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 A8MUA0 341 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 FAM227AF5H4B4 570 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 LRRTM2O43300 516 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 PRAMEF2O60811 474 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 STK16O75716 305 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 FAM155BO75949 473 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 URI1O94763 535 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CRYABP02511 175 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SMIM10L1P0DMW3 83 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 RNH1P13489 461 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CD1DP15813 335 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 MAOAP21397 527 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 GPX6P59796 221 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 RAB10P61026 200 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 HYAL2Q12891 473 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SLMAPQ14BN4 828 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 XKR6Q5GH73 641 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ACER2Q5QJU3 275 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SULT1C3Q6IMI6 304 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 H3F3CQ6NXT2 135 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CTAGE6Q86UF2 777 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CRLF3Q8IUI8 442 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 BEST3Q8N1M1 668 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 STAG3L4Q8TBR4 150 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 FBXO25Q8TCJ0 367 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 FBF1Q8TES7 1133 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CREB3L4Q8TEY5 395 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 TSLPQ969D9 159 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SMIM10Q96HG1 83 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 GPR22Q99680 433 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 RNF32Q9H0A6 362 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CDCP1Q9H5V8 836 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 MMP25Q9NPA2 562 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 LANCL2Q9NS86 450 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 DNAJC11Q9NVH1 559 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-222ENST00000540445 ANKRD10Q9NXR5 420 aa8.47□□□□□ -1.05
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LMO3-222ENST00000540445 LRIT2A6NDA9 550 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 CLDN4O14493 209 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 TAPBPO15533 448 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 ERI3O43414 337 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 CLDN1O95832 211 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 CD46P15529 392 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 HPDP32754 393 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 STX2P32856 288 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 GGT5P36269 586 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 CD96P40200 585 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 SLC6A12P48065 614 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PLA2G16P53816 162 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PER3P56645 1201 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 SLC26A5P58743 744 aa8.46□□□□□ -1.06
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