RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531967.5

ECHDC1-222, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-222	ENST00000531967	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	B9D1	Q9UPM9	204 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967		C9JVG2	144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	BCKDK	O14874	412 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	NME2P1	O60361	137 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	GLRA3	O75311	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	CRYGB	P07316	175 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	ALOX5	P09917	674 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	OXTR	P30559	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR3A1	P47881	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	SORD	Q00796	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	SREBF2	Q12772	1141 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	HYAL1	Q12794	435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	CUL3	Q13618	768 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	GPR157	Q5UAW9	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	SEPT8	Q92599	483 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	TECTB	Q96PL2	329 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	CYP27B1	O15528	508 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	JAK2	O60674	1132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	NUDT17	P0C025	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	MATN1	P21941	496 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	PTPRG	P23470	1445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	LHX1	P48742	406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC7A2	P52569	658 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	PRR20E	P86478	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	PRR20C	P86479	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	PRR20D	P86480	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	PRR20B	P86481	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	PRR20A	P86496	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	IRF8	Q02556	426 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	DMWD	Q09019	674 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	STIM1	Q13586	685 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	AGAP6	Q5VW22	663 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	ENKUR	Q8TC29	256 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	TNN	Q9UQP3	1299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	SYNJ2	O15056	1496 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	USP47	Q96K76	1375 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ECHDC1-222	ENST00000531967		A8MXQ7	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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