RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MAGEB16	A2A368	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CTDSP2	O14595	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	AQP9	O43315	295 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM189A1	O60320	539 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ATP2C2	O75185	946 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	OR2C1	O95371	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	LYPLA2	O95372	231 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RALA	P11233	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CTNNA2	P26232	953 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	HLA-F	P30511	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CASP14	P31944	242 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MAGEA11	P43364	429 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	LIG4	P49917	911 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	STX17	P56962	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62	4e-9	■■■■■ 29.3
PABPC1-223	ENST00000523636	RAPSN	Q13702	412 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	KCNMB4	Q86W47	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TBCK	Q8TEA7	893 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	KLK6	Q92876	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NAT6	Q93015	286 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	BMF	Q96LC9	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	DGAT2	Q96PD7	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CALN1	Q9BXU9	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	LDAH	Q9H6V9	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SPACA6	W5XKT8	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	USF3	Q68DE3	2245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	GSAP	A4D1B5	854 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TSPAN4	O14817	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RASGRF2	O14827	1237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	FOXS1	O43638	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MFAP3L	O75121	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NIPSNAP2	O75323	286 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TACC1	O75410	805 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CEACAM4	O75871	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	STC2	O76061	302 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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