RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494297.5

SRPRB-205, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-205ENST00000494297 SGK494L7N484 410 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 ERVH48-1M5A8F1 160 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 SUPT7LO94864 414 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 BMP10O95393 424 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 MLYCDO95822 493 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 OTCP00480 354 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 IGHEP01854 428 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 UMODP07911 640 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 MYL2P10916 166 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CPA3P15088 417 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CREB1P16220 341 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 FBLP22087 321 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 MMP11P24347 488 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 FOLR3P41439 243 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TSFMP43897 325 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CCNG1P51959 295 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CDH13P55290 713 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 RPS18P62269 152 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 SKP1P63208 163 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CYP4F2P78329 520 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 OCA2Q04671 838 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CLCQ05315 142 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF33BQ06732 778 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TRAF3Q13114 568 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CUL3Q13618 768 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 ERV3-1Q14264 604 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TBR1Q16650 682 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 LINC00303Q3SY05 128 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 KRT71Q3SY84 523 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TMEM35AQ53FP2 167 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 VWA2Q5GFL6 755 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CEP85LQ5SZL2 805 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 DEPDC1Q5TB30 811 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 ABHD17CQ6PCB6 329 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CHSY3Q70JA7 882 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 PRSS41Q7RTY9 318 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 MILR1Q7Z6M3 343 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 EXOC3L1Q86VI1 746 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 PDSS2Q86YH6 399 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 HOMEZQ8IX15 550 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 C4orf33Q8N1A6 199 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 DTWD1Q8N5C7 304 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 OR2L5Q8NG80 312 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 OR4F6Q8NGB9 312 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 OR52B6Q8NGF0 335 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 OR9A4Q8NGU2 314 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 OR51Q1Q8NH59 317 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 HUS1BQ8NHY5 278 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 STT3BQ8TCJ2 826 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TCP10LQ8TDR4 215 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 PPP4R1Q8TF05 950 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TTC9Q92623 222 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 ATP6V1E2Q96A05 226 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 GAL3ST3Q96A11 431 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 REPS1Q96D71 796 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CMTM7Q96FZ5 175 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 APOPT1Q96IL0 206 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 PKNOX2Q96KN3 472 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 QRFPRQ96P65 431 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TMEM237Q96Q45 408 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 OR1F2PQ96R84 312 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 MS4A8Q9BY19 250 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 ROGDIQ9GZN7 287 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 AICDAQ9GZX7 198 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 GSTO2Q9H4Y5 243 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 ACTR8Q9H981 624 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 PRDM7Q9NQW5 492 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 SEMA3GQ9NS98 782 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 C14orf105Q9NVL8 296 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 OXSMQ9NWU1 459 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TRPC4Q9UBN4 977 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CTSFQ9UBX1 484 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 MID2Q9UJV3 735 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF225Q9UK10 706 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 STK38LQ9Y2H1 464 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 RNF11Q9Y3C5 154 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 KCNMB2Q9Y691 235 aa5.09□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 SDK2Q58EX2 2172 aa5.08□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 KIF26BQ2KJY2 2108 aa5.08□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa5.08□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 A0A088AWK7 358 aa5.08□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 A0A1B0GTL3 188 aa5.08□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 A0A1W2PQ72 361 aa5.08□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 MAGEB17A8MXT2 336 aa5.08□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 C4orf51C9J302 202 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms