RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLCO2B1O94956 709 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FADS2O95864 444 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPTBP11277 2137 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSMB9P28065 219 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VLDLRP98155 873 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SELENBP1Q13228 472 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAPK11Q15759 364 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FRMD1Q8N878 549 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COQ10AQ96MF6 247 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR70Q9NW82 654 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A096LPI6 279 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPC1O15118 1278 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPNE6O95741 557 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CBSLP0DN79 551 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LAMP1P11279 417 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CBSP35520 551 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAD23AP54725 363 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB15P59190 212 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ISL1P61371 349 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TFF2Q03403 129 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RUNX3Q13761 415 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GBX1Q14549 363 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYCE2Q6PIF2 218 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC38A6Q8IZM9 456 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OTUB2Q96DC9 234 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XKR8Q9H6D3 395 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COL4A3Q01955 1670 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CKAP5Q14008 2032 aa14.9□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEC14L2O76054 403 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GSTM1P09488 218 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INHBBP09529 407 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRLHRP49683 370 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IFITM2Q01629 132 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBE3AQ05086 875 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DUSP6Q16828 381 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATG9BQ674R7 924 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUN5Q8TC36 379 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBTD2Q8WUN7 234 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAD21L1Q9H4I0 556 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RUBCNLQ9H714 662 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CARNS1A5YM72 827 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CATP04040 527 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AMD1P17707 334 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TGFBR1P36897 503 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC58Q4VC31 144 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBE2UQ5VVX9 321 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 YAF2Q8IY57 180 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SVOPLQ8N434 492 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR7G1Q8NGA0 311 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR52J3Q8NH60 311 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NELL1Q92832 810 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLMNQ92990 594 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C5AR2Q9P296 337 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSME2Q9UL46 239 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.89□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM220BPB1ANY3 271 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPN2O95208 641 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD72P21854 359 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DAPP51397 102 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OCA2Q04671 838 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDK5R2Q13319 367 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MOGQ16653 247 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UGT8Q16880 541 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPZQ66K79 652 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSH2DQ96JZ2 352 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms