RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479894.1

HDLBP-238, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 840 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-238	ENST00000479894	GPR137	Q96N19	417 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	SLC30A3	Q99726	388 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	NRTN	Q99748	197 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	CRB3	Q9BUF7	120 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	XKR8	Q9H6D3	395 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	TBK1	Q9UHD2	729 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	ICK	Q9UPZ9	632 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	HMX2	A2RU54	273 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	OR5H15	A6NDH6	313 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894		E9PLN8	166 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	MYO1C	O00159	1063 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	FKBP9	O95302	570 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	TSPAN12	O95859	305 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	WDPCP	O95876	746 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	CCND1	P24385	295 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	HNMT	P50135	292 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	AP2B1	P63010	937 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	CDKL1	Q00532	357 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	CSHL1	Q14406	222 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	NAA25	Q14CX7	972 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	KIAA1191	Q96A73	305 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	PGM2	Q96G03	612 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	HGH1	Q9BTY7	390 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	CUTC	Q9NTM9	273 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	CTSF	Q9UBX1	484 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	ANXA5	P08758	320 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	COX6A1	P12074	109 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	CD1D	P15813	335 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	ZNF844	Q08AG5	666 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	PRKG2	Q13237	762 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	CES4A	Q5XG92	561 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	GPSM1	Q86YR5	675 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	ZIM3	Q96PE6	472 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	SMC6	Q96SB8	1091 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	ZNF559	Q9BR84	538 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	ARL15	Q9NXU5	204 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	NFS1	Q9Y697	457 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	WFS1	O76024	890 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	LTB	Q06643	244 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	KLC1	Q07866	573 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	ZNF460	Q14592	562 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	GRM7	Q14831	915 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	KIR2DS3	Q14952	304 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	TCTE1	Q5JU00	501 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	SMPDL3A	Q92484	453 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	MID2	Q9UJV3	735 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	RNF112	Q9ULX5	631 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	OARD1	Q9Y530	152 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
HDLBP-238	ENST00000479894	VPS13C	Q709C8	3753 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-238	ENST00000479894	COPE	O14579	308 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-238	ENST00000479894	KERA	O60938	352 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-238	ENST00000479894	GLRA3	O75311	464 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-238	ENST00000479894	WISP2	O76076	250 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-238	ENST00000479894	CCNDBP1	O95273	360 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-238	ENST00000479894	F10	P00742	488 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-238	ENST00000479894	TFEB	P19484	476 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-238	ENST00000479894	TAC1	P20366	129 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-238	ENST00000479894	PMP22	Q01453	160 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-238	ENST00000479894	OCA2	Q04671	838 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-238	ENST00000479894	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-238	ENST00000479894	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDLBP-238	ENST00000479894	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.9 ms