RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 ERASQ7Z444 233 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF679Q8IYX0 411 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 EID3Q8N140 333 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 SMRP1Q8NCR6 262 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 STKLD1Q8NE28 680 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 STEAP2Q8NFT2 490 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 OR52K2Q8NGK3 314 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 OR52N5Q8NH56 324 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CHPT1Q8WUD6 406 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 DDB2Q92466 427 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB39BQ96DA2 213 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CBWD1Q9BRT8 395 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 MTMR12Q9C0I1 747 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CSTL1Q9H114 145 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 GANQ9H2C0 597 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 PELI2Q9HAT8 420 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 TM9SF3Q9HD45 589 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 HPS4Q9NQG7 708 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 FGF21Q9NSA1 209 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP6V1HQ9UI12 483 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0G2JPF8 293 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 LGALS8O00214 317 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CHEK1O14757 476 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 EPOP01588 193 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 YES1P07947 543 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 GSTA2P09210 222 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CT45A8P0DMV1 189 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CT45A9P0DMV2 189 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 TOP1P11387 765 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 GP1BBP13224 206 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 HLA-DOBP13765 273 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 EZRP15311 586 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 RPA2P15927 270 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 FCARP24071 287 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 IL4RP24394 825 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 OR1D2P34982 312 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ADRA1AP35348 466 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 MAZP56270 477 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 C21orf58P58505 322 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 BEX3Q00994 111 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 Q0VFX4 171 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 KEAP1Q14145 624 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 SPHARQ15513 63 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 PDK4Q16654 411 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ADPRMQ3LIE5 342 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 GPAT3Q53EU6 434 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 AGKQ53H12 422 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CT45A2Q5DJT8 189 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ZYG11AQ6WRX3 759 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CDH26Q8IXH8 852 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 RCOR2Q8IZ40 523 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 OR56B2PQ8NGI1 322 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4C15Q8NGM1 316 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 NCLNQ969V3 563 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 MARK4Q96L34 752 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 BTBD9Q96Q07 612 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 EDEM2Q9BV94 578 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR76Q9H967 626 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 VDAC3Q9Y277 283 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 MAB21L2Q9Y586 359 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ETV7Q9Y603 341 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PN81 502 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF587BE7ETH6 402 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 K7EQM0 130 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 TULP2O00295 520 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CPNE6O95741 557 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 PMS2P2O95744 297 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CA3P07451 260 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP6V1C1P21283 382 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CA4P22748 312 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 LHCGRP22888 699 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ALDH4A1P30038 563 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CHRNA7P36544 502 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC6A8P48029 635 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CDH11P55287 796 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CCNA1P78396 465 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAF3Q13114 568 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR33Q49SQ1 333 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 NCR3LG1Q68D85 454 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CRIP3Q6Q6R5 217 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 GCNT2Q8N0V5 402 aa5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms