RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SPG11Q96JI7 2443 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 A0A1W2PQF6 199 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 NEMP2A6NFY4 417 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PRRT4C9JH25 899 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 UBXN8O00124 270 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TRIM24O15164 1050 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RAD51BO15315 384 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 KAT7O95251 611 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CBX6O95503 412 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CER1O95813 267 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MLYCDO95822 493 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 FTH1P02794 183 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 APODP05090 189 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 NQO1P15559 274 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CHRM3P20309 590 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PTPN4P29074 926 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 AKT1P31749 480 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 WASP42768 502 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PIK3CGP48736 1102 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MNAT1P51948 309 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PGGT1BP53609 377 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ENPP2Q13822 863 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GBX1Q14549 363 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ZNF234Q14588 700 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 HERC3Q15034 1050 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 IGFBP7Q16270 282 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GPRC6AQ5T6X5 926 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ANKS6Q68DC2 871 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TTC23LQ6PF05 361 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SBSNQ6UWP8 590 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 LAYNQ6UX15 382 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TTC7BQ86TV6 843 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 LSMEM2Q8N112 164 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 DNASE2BQ8WZ79 361 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SGF29Q96ES7 293 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 DTD2Q96FN9 168 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ZNF382Q96SR6 550 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CCT7Q99832 543 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ZNF385DQ9H6B1 395 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MEAF6Q9HAF1 191 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RDH14Q9HBH5 336 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 DYRK4Q9NR20 520 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PNPOQ9NVS9 261 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.42e-8■□□□□ 9.9
CCL20-202ENST00000409189 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 OARD1Q9Y530 152 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 UBE2QL1A1L167 161 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 K7ENP7 123 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CDC7O00311 574 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 AREL1O15033 823 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SLC16A5O15375 505 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 KLK10O43240 276 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GRID2O43424 1007 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 AP1G1O43747 822 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 VPS4BO75351 444 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RASSF9O75901 435 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SUPT7LO94864 414 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 C8GP07360 202 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MPC1LP0DKB6 136 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ADRB3P13945 408 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 EZRP15311 586 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GNSP15586 552 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 VCLP18206 1134 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PRLHRP49683 370 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ACADVLP49748 655 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ATP4BP51164 291 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 COPAP53621 1224 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 UCNP55089 124 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PKNOX1P55347 436 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CDKL1Q00532 357 aa6.32□□□□□ -1.4
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