RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 C5orf42Q9H799 3197 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SERTM1A2A2V5 107 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 H0YIV9 168 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 K7ESM1 405 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PLK4O00444 970 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TLL1O43897 1013 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PRMT3O60678 531 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 KLHL18O94889 574 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CDK1P06493 297 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 C8AP07357 584 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ADORA3P0DMS8 318 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 GRK3P35626 688 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CTSKP43235 329 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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PTPRR-202ENST00000342084 C2orf80Q0P641 193 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPRR-202ENST00000342084 GRIN2CQ14957 1233 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 MPP7Q5T2T1 576 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TTC23LQ6PF05 361 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 COMMD6Q7Z4G1 85 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF675Q8TD23 568 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF480Q8WV37 535 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 IL17FQ96PD4 163 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 DEFB118Q96PH6 123 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 QPCTLQ9NXS2 382 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 GULP1Q9UBP9 304 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 BTNL2Q9UIR0 455 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PADI2Q9Y2J8 665 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SLC5A10A0PJK1 596 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CLDN24A6NM45 220 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SSX4O60224 188 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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PTPRR-202ENST00000342084 HNF4AP41235 474 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TAS2R50P59544 299 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 FADDQ13158 208 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TEAD2Q15562 447 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SLC5A12Q1EHB4 618 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 LEXMQ3ZCV2 418 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TRIM60Q495X7 471 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 IFI44LQ53G44 452 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 STEAP3Q658P3 488 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 MED27Q6P2C8 311 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.97□□□□□ -1.29
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PTPRR-202ENST00000342084 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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PTPRR-202ENST00000342084 ABHD8Q96I13 439 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 OR5M11Q96RB7 305 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 FAM129BQ96TA1 746 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PHOX2BQ99453 314 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.97□□□□□ -1.29
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PTPRR-202ENST00000342084 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 GIN1Q9NXP7 522 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SPASTQ9UBP0 616 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 RAB23Q9ULC3 237 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 DUSP12Q9UNI6 340 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PIPSLA2A3N6 862 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CLCA1A8K7I4 914 aa6.96□□□□□ -1.29
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