RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 SUV39H1O43463 412 aa15.72■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 SULT1C4O75897 302 aa15.72■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 PTPN2P17706 415 aa15.72■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 RRM2P31350 389 aa15.72■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 OR1E2P47887 323 aa15.72■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 WDR45BQ5MNZ6 344 aa15.72■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 FAM180BQ6P0A1 224 aa15.72■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 MED27Q6P2C8 311 aa15.72■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa15.72■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 FAM124AQ86V42 546 aa15.72■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 CADM3Q8N126 398 aa15.72■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 WDR48Q8TAF3 677 aa15.72■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 COQ8BQ96D53 544 aa15.72■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 OR2AG1Q9H205 316 aa15.72■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 RUBCNLQ9H714 662 aa15.72■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 DAPK2Q9UIK4 370 aa15.72■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 TESMINQ9Y4I5 508 aa15.72■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHGA12O60330 932 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 SOD1P00441 154 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 HSD3B1P14060 373 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 JUNDP17535 347 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 HSD3B2P26439 372 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ASMTP46597 345 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 MVDP53602 400 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ADPRMQ3LIE5 342 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 GPR153Q6NV75 609 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF740Q8NDX6 193 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 VPS37AQ8NEZ2 397 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 NDNFQ8TB73 568 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 SPPL2AQ8TCT8 520 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 FOPNLQ96NB1 174 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 NRTNQ99748 197 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 CTRCQ99895 268 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 APOL4Q9BPW4 351 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 KLHL3Q9UH77 587 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 TPRKBQ9Y3C4 175 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 NINQ8N4C6 2090 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 SPINT1O43278 529 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 WBP4O75554 376 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 C6orf47O95873 294 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 VIPP01282 170 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 HLA-EP13747 358 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 PCSK2P16519 638 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 KRT20P35900 424 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 HPCAL1P37235 193 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 EPHA5P54756 1037 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 NPRL3Q12980 569 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 PRSS53Q2L4Q9 553 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 SPIN4Q56A73 249 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 PERM1Q5SV97 790 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 FAHD1Q6P587 224 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 CPA6Q8N4T0 437 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 OR52J3Q8NH60 311 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 KCNC2Q96PR1 638 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa15.71■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 QSOX1O00391 747 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 FAM20BO75063 409 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 TIMP1P01033 207 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 C9P02748 559 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 ACVR2AP27037 513 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 PSMB9P28065 219 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 VBP1P61758 197 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 COMMD6Q7Z4G1 85 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 OR5AK3PQ8NH89 298 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 SCN3BQ9NY72 215 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 IDUAP35475 653 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 TPTEP56180 551 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 CARTPTQ16568 116 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 MPEG1Q2M385 716 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 ERAP2Q6P179 960 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 SPRED2Q7Z698 418 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 MMP21Q8N119 569 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 APH1BQ8WW43 257 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 RLIMQ9NVW2 624 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 ADPRHL2Q9NX46 363 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 TBC1D14Q9P2M4 693 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 GPSM3Q9Y4H4 160 aa15.7■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 KLHL18O94889 574 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 EPCAMP16422 314 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 TGFBR1P36897 503 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 CLCA4Q14CN2 919 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 DHCR24Q15392 516 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 ANXA8L1Q5VT79 327 aa15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms