RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 ACOT13Q9NPJ3 140 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 GPATCH2Q9NW75 528 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 TAS2R9Q9NYW1 312 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 SPASTQ9UBP0 616 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 CLDN25C9JDP6 229 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 M0R3G1 203 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 TGFB1P01137 390 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 ETFAP13804 333 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 KRT20P35900 424 aa18.76■□□□□ 0.59
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SPNS1-201ENST00000311008 LAIR1Q6GTX8 287 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 KRT78Q8N1N4 520 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 SAMD11Q96NU1 681 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 C1GALT1Q9NS00 363 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 AHSPQ9NZD4 102 aa18.76■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 COQ6Q9Y2Z9 468 aa18.76■□□□□ 0.59
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SPNS1-201ENST00000311008 PAPLNO95428 1278 aa18.75■□□□□ 0.59
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SPNS1-201ENST00000311008 EPHA2P29317 976 aa18.75■□□□□ 0.59
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SPNS1-201ENST00000311008 MAP2K4P45985 399 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 TEKQ02763 1124 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP18.75■□□□□ 0.599e-8■■■■□ 25.5
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SPNS1-201ENST00000311008 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 ENTHD1Q8IYW4 607 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 SPPL3Q8TCT6 385 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 CHPT1Q8WUD6 406 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 OR51B5Q9H339 312 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 POFUT2Q9Y2G5 429 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa18.75■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 PCDHGA12O60330 932 aa18.74■□□□□ 0.59
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SPNS1-201ENST00000311008 PSMB9P28065 219 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
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SPNS1-201ENST00000311008 TAS2R50P59544 299 aa18.74■□□□□ 0.59
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SPNS1-201ENST00000311008 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 SIGLEC11Q96RL6 698 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 RAD9AQ99638 391 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 RASSF1Q9NS23 344 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 DPP7Q9UHL4 492 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 SH2B3Q9UQQ2 575 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 ERGIC3Q9Y282 383 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 DGKBQ9Y6T7 804 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 FGBP02675 491 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 EPCAMP16422 314 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 CDK6Q00534 326 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 RPA4Q13156 261 aa18.74■□□□□ 0.59
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SPNS1-201ENST00000311008 RGS21Q2M5E4 152 aa18.74■□□□□ 0.59
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SPNS1-201ENST00000311008 C9orf64Q5T6V5 341 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 SLCO6A1Q86UG4 719 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 OR10G2Q8NGC3 310 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 WDR48Q8TAF3 677 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 ING5Q8WYH8 240 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
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SPNS1-201ENST00000311008 ENOPH1Q9UHY7 261 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 ICKQ9UPZ9 632 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 TESMINQ9Y4I5 508 aa18.74■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 PCM1Q15154 2024 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 NOTCH4Q99466 2003 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1W2PRB8 838 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 K7ESM1 405 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 FADS2O95864 444 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 KLK1P06870 262 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 HLA-EP13747 358 aa18.73■□□□□ 0.59
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