RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 LPAR4Q99677 370 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 CPNE1Q99829 537 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 SLX1AQ9BQ83 275 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC6A16Q9GZN6 736 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 LANCL2Q9NS86 450 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 ABI3Q9P2A4 366 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 SCN3AQ9NY46 2000 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRVP-204ENST00000639439 NOTCH2Q04721 2471 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 A8MUI8 341 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 RAD51CO43502 376 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 CHST10O43529 356 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 SERPINA6P08185 405 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 GSTM2P28161 218 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 SSTR1P30872 391 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 CASQ1P31415 396 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 GP5P40197 560 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC6A12P48065 614 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 C4orf17Q53FE4 359 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 SFT2D3Q587I9 215 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 CDKL4Q5MAI5 379 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 H3F3CQ6NXT2 135 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 OR5T3Q8NGG3 340 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 RHBDF1Q96CC6 855 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 RBCK1Q9BYM8 510 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 RAB17Q9H0T7 212 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 KCNK13Q9HB14 408 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 MMP25Q9NPA2 562 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 OR2W5A6NFC9 320 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 CDK2AP1O14519 115 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 PRAMEF2O60811 474 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 WDR47O94967 919 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 RNF224P0DH78 156 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 RNH1P13489 461 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 STMN1P16949 149 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 PER3P56645 1201 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 OR4D2P58180 307 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 TAS2R50P59544 299 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 ATP6V0D1P61421 351 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 TGFBIQ15582 683 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 MEP1AQ16819 746 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 ACER2Q5QJU3 275 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 SHISA5Q8N114 240 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 KRT78Q8N1N4 520 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC5A8Q8N695 610 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 NR4A3Q92570 626 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 GPR22Q99680 433 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 RBBP8Q99708 897 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 UNC79Q9P2D8 2635 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 SCN2AQ99250 2005 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM159BA6NKW6 160 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 PRMT3O60678 531 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 RASAL1O95294 804 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 F10P00742 488 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 CCDC166P0CW27 439 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 SMIM10L1P0DMW3 83 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 HNF4AP41235 474 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 RAB8AP61006 207 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 C2orf54Q08AI8 447 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 GPSM1Q86YR5 675 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 LGI4Q8N135 537 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRVP-204ENST00000639439 CREB3L4Q8TEY5 395 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms