RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638048.1

RASGEF1B-214, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RASGEF1B, Length 2,386 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-214ENST00000638048 EXOC2Q96KP1 924 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 CIPCQ9C0C6 399 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 ALG2Q9H553 416 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 CAB39LQ9H9S4 337 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 IL36AQ9UHA7 158 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 C3orf18Q9UK00 162 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 DUSP12Q9UNI6 340 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 C19orf67A6NJJ6 358 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 ZNF98A6NK75 572 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 F5H423 210 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 UBXN8O00124 270 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 NR5A2O00482 541 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 MAN2B1O00754 1011 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 PPM1BO75688 479 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 IFNA14P01570 189 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 ADORA3P0DMS8 318 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 NCK1P16333 377 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 SOX6P35712 828 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 TRIM23P36406 574 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 CENPAP49450 140 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 DCDC1P59894 354 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 ISL1P61371 349 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 KCNAB2Q13303 367 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 OLIG2Q13516 323 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 TDGQ13569 410 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 RIN1Q13671 783 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 CORO6Q6QEF8 472 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 TPRG1Q6ZUI0 275 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 Q6ZVU0 165 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 USP45Q70EL2 814 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 KCNMB4Q86W47 210 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 ADHFE1Q8IWW8 467 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 TAGAPQ8N103 731 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 OR8K3Q8NH51 312 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 OR2A14Q96R47 310 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 APOL2Q9BQE5 337 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 IFT46Q9NQC8 304 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 ING3Q9NXR8 418 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 SLC39A1Q9NY26 324 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 EMC3Q9P0I2 261 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 HCN2Q9UL51 889 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 AUP1Q9Y679 476 aa6.45□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 PRSS44E7EML9 344 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 K7EQS6 105 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 SH3BP5O60239 455 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 NPHS1O60500 1241 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 TNFRSF21O75509 655 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 GJB3O75712 270 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 SLC22A5O76082 557 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 S100A6P06703 90 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 CD9P21926 228 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 NMBRP28336 390 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 TIE1P35590 1138 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 SOX11P35716 441 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 PIGAP37287 484 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 ETV6P41212 452 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 GLRBP48167 497 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 CCT3P49368 545 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 TPMTP51580 245 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 CDK5R2Q13319 367 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 BTN1A1Q13410 526 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 PYCR3Q53H96 274 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-214ENST00000638048 ZNF691Q5VV52 312 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms