RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637100.1

CLN3-255, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN3, Length 1,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-255ENST00000637100 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa15.4■□□□□ 0.06
CLN3-255ENST00000637100 NT5CQ8TCD5 201 aa15.4■□□□□ 0.06
CLN3-255ENST00000637100 CALML6Q8TD86 181 aa15.4■□□□□ 0.06
CLN3-255ENST00000637100 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa15.4■□□□□ 0.06
CLN3-255ENST00000637100 PEX11GQ96HA9 241 aa15.4■□□□□ 0.06
CLN3-255ENST00000637100 SMIM10Q96HG1 83 aa15.4■□□□□ 0.06
CLN3-255ENST00000637100 HAUS8Q9BT25 410 aa15.4■□□□□ 0.06
CLN3-255ENST00000637100 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
CLN3-255ENST00000637100 ABCF3Q9NUQ8 709 aa15.4■□□□□ 0.06
CLN3-255ENST00000637100 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CLN3-255ENST00000637100 MED13LQ71F56 2210 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 TRBC2A0A5B9 178 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 CHST10O43529 356 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 TSPAN12O95859 305 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 CDH1P12830 882 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 ZNF24P17028 368 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 GRK3P35626 688 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 HLCSP50747 726 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 GPS1Q13098 491 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 NAE1Q13564 534 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 PHKG1Q16816 387 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 DUPD1Q68J44 220 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 UGT3A1Q6NUS8 523 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 TTC27Q6P3X3 843 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 CASC4Q6P4E1 433 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 KIAA0408Q6ZU52 694 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 EID3Q8N140 333 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 KIF2BQ8N4N8 673 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 OR4K3Q96R72 315 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 ATG10Q9H0Y0 220 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 HRH3Q9Y5N1 445 aa15.39■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 PRRG2O14669 202 aa15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 KRT14P02533 472 aa15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 ABOP16442 354 aa15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 JAK1P23458 1154 aa15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 GABRB3P28472 473 aa15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 AHRP35869 848 aa15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 CYB561P49447 251 aa15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 ST13P50502 369 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 CCR8P51685 355 aa15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 GAS2L3Q86XJ1 694 aa15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 CEP97Q8IW35 865 aa15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 NAT8LQ8N9F0 302 aa15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 FAM57AQ8TBR7 257 aa15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 ZFP69BQ9UJL9 534 aa15.38■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 ZNF860A6NHJ4 632 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 SAGE2PA6NJ88 616 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 SCTRP47872 440 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 RGS4P49798 205 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 GPR143P51810 404 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 AP1S2P56377 157 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 SKP1P63208 163 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 HSF1Q00613 529 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 TLE4Q04727 773 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 TFF3Q07654 80 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 HYAL2Q12891 473 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 TERF2Q15554 542 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 MAPKAPK3Q16644 382 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 CYP1B1Q16678 543 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 DEFB134Q4QY38 66 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 PAQR3Q6TCH7 311 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 GALNT7Q86SF2 657 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 CDH24Q86UP0 819 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 CNTN4Q8IWV2 1026 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 RASGEF1CQ8N431 466 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 MARVELD2Q8N4S9 558 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 APCDD1LQ8NCL9 501 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 SNF8Q96H20 258 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 FAM167BQ9BTA0 163 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 SLC6A16Q9GZN6 736 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 TAS2R13Q9NYV9 303 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 CLDN16Q9Y5I7 305 aa15.37■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 ZNHIT1O43257 154 aa15.36■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 CEP104O60308 925 aa15.36■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 PRMT3O60678 531 aa15.36■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 PTGER1P34995 402 aa15.36■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 BTG2P78543 158 aa15.36■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa15.36■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 CMPK2Q5EBM0 449 aa15.36■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 TRIM58Q8NG06 486 aa15.36■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 LILRB4Q8NHJ6 448 aa15.36■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 SDCCAG3Q96C92 435 aa15.36■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 FBXL8Q96CD0 374 aa15.36■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 PTCHD1Q96NR3 888 aa15.36■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 RBCK1Q9BYM8 510 aa15.36■□□□□ 0.05
CLN3-255ENST00000637100 SPNS1Q9H2V7 528 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms