RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618262.4

SRRT-216, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRRT, Length 2,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-216ENST00000618262 H3BMQ9 156 aa11.64□□□□□ -0.55
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SRRT-216ENST00000618262 VAPBO95292 243 aa11.64□□□□□ -0.55
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SRRT-216ENST00000618262 STSP08842 583 aa11.64□□□□□ -0.55
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SRRT-216ENST00000618262 RYKP34925 604 aa11.64□□□□□ -0.55
SRRT-216ENST00000618262 EIF1P41567 113 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
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SRRT-216ENST00000618262 C19orf67A6NJJ6 358 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRT-216ENST00000618262 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa11.63□□□□□ -0.55
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SRRT-216ENST00000618262 GRB7Q14451 532 aa11.63□□□□□ -0.55
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SRRT-216ENST00000618262 LRRC66Q68CR7 880 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRT-216ENST00000618262 FAM151BQ6UXP7 276 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRT-216ENST00000618262 CFAP77Q6ZQR2 320 aa11.63□□□□□ -0.55
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SRRT-216ENST00000618262 OR4K2Q8NGD2 314 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRT-216ENST00000618262 PIH1D2Q8WWB5 315 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRT-216ENST00000618262 SIPA1Q96FS4 1042 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRT-216ENST00000618262 MRGPRX1Q96LB2 322 aa11.63□□□□□ -0.55
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SRRT-216ENST00000618262 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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SRRT-216ENST00000618262 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SRRT-216ENST00000618262 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
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SRRT-216ENST00000618262 FZD5Q13467 585 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRT-216ENST00000618262 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.552e-10■■■□□ 14.8
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SRRT-216ENST00000618262 SEL1L3Q68CR1 1132 aa11.63□□□□□ -0.55
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SRRT-216ENST00000618262 PELI3Q8N2H9 469 aa11.63□□□□□ -0.55
SRRT-216ENST00000618262 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SRRT-216ENST00000618262 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
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SRRT-216ENST00000618262 EPB41L4BQ9H329 900 aa11.63□□□□□ -0.55
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SRRT-216ENST00000618262 MADCAM1Q13477 382 aa11.62□□□□□ -0.55
SRRT-216ENST00000618262 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa11.62□□□□□ -0.55
SRRT-216ENST00000618262 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa11.62□□□□□ -0.55
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