RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NPRL3Q12980 569 aa11.31□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NXPE4Q6UWF7 544 aa11.31□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa11.31□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC15A4Q8N697 577 aa11.31□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPCDCQ96CD2 204 aa11.31□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FEVQ99581 238 aa11.31□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DOHHQ9BU89 302 aa11.31□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LGR4Q9BXB1 951 aa11.31□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABCG4Q9H172 646 aa11.31□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADPRHL2Q9NX46 363 aa11.31□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C5AR2Q9P296 337 aa11.31□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SH3PXD2BA1X283 911 aa11.3□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MT-ND2P03891 347 aa11.3□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL3P08700 152 aa11.3□□□□□ -0.6
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