RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 MDGA2Q7Z553 956 aa20.34■□□□□ 0.85
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CAPNS1-205ENST00000588780 SLC13A3Q8WWT9 602 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-205ENST00000588780 THAP11Q96EK4 314 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-205ENST00000588780 SMC6Q96SB8 1091 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-205ENST00000588780 ATG10Q9H0Y0 220 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-205ENST00000588780 ALKBH4Q9NXW9 302 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-205ENST00000588780 CRYL1Q9Y2S2 319 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-205ENST00000588780 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.34■□□□□ 0.85
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CAPNS1-205ENST00000588780 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa20.33■□□□□ 0.85
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CAPNS1-205ENST00000588780 TM4SF19Q96DZ7 209 aa20.29■□□□□ 0.84
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CAPNS1-205ENST00000588780 LDAHQ9H6V9 325 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-205ENST00000588780 HPF1Q9NWY4 346 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-205ENST00000588780 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM215AQ9Y5M1 114 aa20.29■□□□□ 0.84
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