RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-229	ENST00000551936	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	KRT12	Q99456	494 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	KLHL31	Q9H511	634 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	MMP25	Q9NPA2	562 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ABI3	Q9P2A4	366 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	OARD1	Q9Y530	152 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	MYBL2	P10244	700 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	MST1	P26927	711 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	DCT	P40126	519 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	KCNK10	P57789	538 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	OR4D2	P58180	307 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	MEP1A	Q16819	746 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ABHD13	Q7L211	337 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	BEST3	Q8N1M1	668 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	TRPV3	Q8NET8	790 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	RELT	Q969Z4	430 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	LPAR4	Q99677	370 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	AICDA	Q9GZX7	198 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SVIL	O95425	2214 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936		A0A1B0GUH1	482 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	URAD	A6NGE7	173 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	MAN1A2	O60476	641 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	PIAS1	O75925	651 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	WISP2	O76076	250 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	HNF4A	P41235	474 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	GDF5	P43026	501 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SLC6A12	P48065	614 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	HNMT	P50135	292 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	PER3	P56645	1201 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SLC26A5	P58743	744 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	RAB8A	P61006	207 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SKP1	P63208	163 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	BTG2	P78543	158 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	TUBA3C	Q13748	450 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ZNF766	Q5HY98	468 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	FJX1	Q86VR8	437 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ELP5	Q8TE02	316 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	VPS39	Q96JC1	886 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	EGFL8	Q99944	293 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	GPAM	Q9HCL2	828 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	C4orf51	C9J302	202 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	NDC80	O14777	642 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ZG16	O60844	167 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	B4GALT2	O60909	372 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SERPINA6	P08185	405 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	JAK1	P23458	1154 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SSTR1	P30872	391 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	CD96	P40200	585 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	PMP22	Q01453	160 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	BBOF1	Q8ND07	529 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	MDS2	Q8NDY4	140 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SCMH1	Q96GD3	660 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ERP44	Q9BS26	406 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	DERL2	Q9GZP9	239 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	DPH5	Q9H2P9	285 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	CACNA1D	Q01668	2161 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	FAM187A	A6NFU0	413 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	FAM227A	F5H4B4	570 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TAPBP	O15533	448 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	PRMT3	O60678	531 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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