RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TRBC2	A0A5B9	178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	OR6C74	A6NCV1	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SOCS6	O14544	535 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	GPR42	O15529	346 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MTX2	O75431	263 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TGFA	P01135	160 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	IL1A	P01583	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CSF2	P04141	144 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MCF2	P10911	925 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ETS1	P14921	441 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	EGR1	P18146	543 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CHRM3	P20309	590 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PRKACB	P22694	351 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62	6e-18	■□□□□ 8
PABPC1-223	ENST00000523636	PCSK1	P29120	753 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CHRNA3	P32297	505 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TTK	P33981	857 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	BMI1	P35226	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NAMPT	P43490	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PGD	P52209	483 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ARFIP2	P53365	341 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CLDN2	P57739	230 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TUBA1B	P68363	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ABAT	P80404	500 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CUL1	Q13616	776 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CBFB	Q13951	182 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CEBPE	Q15744	281 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CST6	Q15828	149 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	VWA2	Q5GFL6	755 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	HHAT	Q5VTY9	493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NEK5	Q6P3R8	708 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	KLHL35	Q6PF15	583 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TUBA1A	Q71U36	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TC2N	Q8N9U0	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	OR8K5	Q8NH50	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ERMN	Q8TAM6	284 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CDKL2	Q92772	493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	HAS1	Q92839	578 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PEX13	Q92968	403 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM159	Q96B96	161 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	LYST	Q99698	3801 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CMKLR1	Q99788	373 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CLPB	Q9H078	707 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PRELID1	Q9Y255	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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