RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TMED5Q9Y3A6 229 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 OR1A2Q9Y585 309 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 LRRK1Q38SD2 2015 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 LRRC72A6NJI9 287 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 FAM170BA6NMN3 283 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 CLDN25C9JDP6 229 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 H3BM21 787 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TOR1BO14657 336 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 PRAMEF4O60810 478 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ULK1O75385 1050 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV4-34P06331 123 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 PGRP06401 933 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 HIST1H2ADP20671 130 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 CYP2A7P20853 494 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ELK4P28324 431 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 HTR6P50406 440 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 CXCR4P61073 352 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 KCNC4Q03721 635 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF33BQ06732 778 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 BNIP3Q12983 259 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 KEAP1Q14145 624 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 LRRC32Q14392 662 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 NFE2L1Q14494 772 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 NR1D2Q14995 579 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 KIAA0040Q15053 153 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 DPY19L1Q2PZI1 675 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 CCSMST1Q4G0I0 132 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 GGTA1PQ4G0N0 100 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 PYCR3Q53H96 274 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 RUNDC3AQ59EK9 446 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM31Q5JXX7 168 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF691Q5VV52 312 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 XAF1Q6GPH4 301 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ERICH5Q6P6B1 374 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 SCIMPQ6UWF3 145 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 UNC5DQ6UXZ4 953 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 DCDC5Q6ZRR9 648 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ARL10Q8N8L6 244 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 L3MBTL4Q8NA19 623 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM145Q8NBT3 493 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 OR56A3Q8NH54 315 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 SNX19Q92543 992 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 GTF2H4Q92759 462 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 SHDQ96IW2 340 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 PHF12Q96QT6 1004 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 MBOAT4Q96T53 435 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 PKP4Q99569 1192 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 HIST1H2AJQ99878 128 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 EGFL8Q99944 293 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ORAI3Q9BRQ5 295 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TIMM29Q9BSF4 260 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 H2AFJQ9BTM1 129 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 KCNH6Q9H252 994 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ACTL8Q9H568 366 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 NECTIN3Q9NQS3 549 aa9.23□□□□□ -0.93
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POLR1A-208ENST00000486964 SCN3BQ9NY72 215 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 SLAMF8Q9P0V8 285 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 MAPRE3Q9UPY8 281 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 ERGIC3Q9Y282 383 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 CCL27Q9Y4X3 112 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 V9GYQ6 96 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 MYO10Q9HD67 2058 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa9.22□□□□□ -0.93
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POLR1A-208ENST00000486964 SERTM1A2A2V5 107 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 POM121BA6NF01 834 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 NPIPB8E9PQR5 432 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 M0QX08 132 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 TNFRSF10CO14798 259 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 BCKDKO14874 412 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 SLC31A1O15431 190 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 DFNA5O60443 496 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 GPR37L1O60883 481 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 SULT1C4O75897 302 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 GABARAPO95166 117 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 APBB3O95704 486 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 SEMA4FO95754 770 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 MT-ND1P03886 318 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 CATP04040 527 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 NTRK1P04629 796 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 EPB42P16452 691 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-208ENST00000486964 MATN1P21941 496 aa9.22□□□□□ -0.93
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