RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KAT7O95251 611 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EPCAMP16422 314 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERVK-21P61565 698 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPL19P84098 196 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHAF1BQ13112 559 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DSG2Q14126 1118 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR52E4Q8NGH9 312 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC35F5Q8WV83 523 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLK6Q92876 244 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ASPNQ9BXN1 380 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARVCFO00192 962 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCL5P13501 91 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF792Q3KQV3 632 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 JAGN1Q8N5M9 183 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMIEQ8NEW7 156 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C11orf49Q9H6J7 331 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERI3O43414 337 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CTC1Q2NKJ3 1217 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF101Q8IZC7 436 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FNDC8Q8TC99 324 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBXL18Q96ME1 805 aa16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC31A1O15431 190 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CXCR1P25024 350 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC9A3P48764 834 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GALNT2Q10471 571 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNAB2Q13303 367 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SEC23BQ15437 767 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARSIQ5FYB1 569 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC39A4Q6P5W5 647 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 XKRXQ6PP77 449 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GDPD4Q6W3E5 623 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ASB12Q8WXK4 309 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BTBD1Q9H0C5 482 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IL36AQ9UHA7 158 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCHNA4D1U4 455 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NDUFS4O43181 175 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ABHD13Q7L211 337 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF130Q86XS8 419 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EGFL6Q8IUX8 553 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EBF1Q9UH73 591 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DFNA5O60443 496 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 F8A1P23610 371 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STC1P52823 247 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAS2R50P59544 299 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OCLNQ16625 522 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HMBOX1Q6NT76 420 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLEKHO2Q8TD55 490 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD244Q9BZW8 370 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMURF1Q9HCE7 757 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBP2O00757 339 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLDN7O95471 211 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STATHP02808 62 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GBAP04062 536 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR1E2P47887 323 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ST3GAL4Q11206 333 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCTD9Q7L273 389 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEP97Q8IW35 865 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAS2R10Q9NYW0 307 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAC3Q9UHF0 121 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 Q9Y3F1 56 aa16.61■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EOMESO95936 686 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BMP8BP34820 402 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AGTR2P50052 363 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPS13P62277 151 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ENPP2Q13822 863 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ODF4Q2M2E3 257 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF700Q9H0M5 742 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A1B0GVT2 93 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRRN3E7EW58 273 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NARSO43776 548 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RP2O75695 350 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCKBRP32239 447 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DIO3P55073 304 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MLLT10P55197 1068 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CYP27C1Q4G0S4 372 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C6orf141Q5SZD1 244 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LNX2Q8N448 690 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKFN1Q8N957 763 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 THEM6Q8WUY1 208 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BIRC8Q96P09 236 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ABCG4Q9H172 646 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRRN3Q9H3W5 708 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FNIP2Q9P278 1114 aa16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms