RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480205.5

PSMD6-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 6, human

TSL 3

Gene PSMD6, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD6-208	ENST00000480205	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	POMT2	Q9UKY4	750 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	PCM1	Q15154	2024 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ZAN	Q9Y493	2812 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205		F8VZ95	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205		H3BMH7	237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	AGPS	O00116	658 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	BTN3A3	O00478	584 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ADAM10	O14672	748 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	MGST3	O14880	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	SLC43A1	O75387	559 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	GFPT2	O94808	682 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	PYGL	P06737	847 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	TCF4	P15884	667 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ZNF30	P17039	623 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	IGFBP2	P18065	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	CDH3	P22223	829 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	IDS	P22304	550 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	PCSK6	P29122	969 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	HADHA	P40939	763 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	MMP13	P45452	471 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	TNFSF10	P50591	281 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	RENBP	P51606	427 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	EPHB1	P54762	984 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	HSF1	Q00613	529 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	MFAP5	Q13361	173 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ODF1	Q14990	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ATL3	Q6DD88	541 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	OR8K5	Q8NH50	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	GLYATL1	Q969I3	302 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	HDAC11	Q96DB2	347 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	GSDMA	Q96QA5	445 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	CD180	Q99467	661 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	NUP85	Q9BW27	656 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	CTSF	Q9UBX1	484 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	MEMO1	Q9Y316	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD6-208	ENST00000480205		A0A1W2PQ67	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMD6-208	ENST00000480205		A0A1W2PS29	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMD6-208	ENST00000480205	GSAP	A4D1B5	854 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMD6-208	ENST00000480205		E7EQ34	232 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMD6-208	ENST00000480205	EPHB6	O15197	1021 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMD6-208	ENST00000480205	KMO	O15229	486 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMD6-208	ENST00000480205	PEX1	O43933	1283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMD6-208	ENST00000480205	SMC2	O95347	1197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMD6-208	ENST00000480205	GNA14	O95837	355 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMD6-208	ENST00000480205	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PSMD6-208	ENST00000480205	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMD6-208	ENST00000480205	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PSMD6-208	ENST00000480205	GABRA4	P48169	554 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMD6-208	ENST00000480205	KLK7	P49862	253 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMD6-208	ENST00000480205	SMS	P52788	366 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMD6-208	ENST00000480205	ARG2	P78540	354 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMD6-208	ENST00000480205	CDR2	Q01850	454 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMD6-208	ENST00000480205	TMED1	Q13445	227 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMD6-208	ENST00000480205	STIM1	Q13586	685 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMD6-208	ENST00000480205	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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