RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 PEX11GQ96HA9 241 aa22.65■■□□□ 1.22
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SMKR1-201ENST00000462322 SLC6A16Q9GZN6 736 aa22.65■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 EHD1Q9H4M9 534 aa22.65■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 LUZP4Q9P127 313 aa22.65■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa22.64■■□□□ 1.21
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SMKR1-201ENST00000462322 SLC6A19Q695T7 634 aa22.64■■□□□ 1.21
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SMKR1-201ENST00000462322 LANCL3Q6ZV70 420 aa22.62■■□□□ 1.21
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SMKR1-201ENST00000462322 TUBB6Q9BUF5 446 aa22.61■■□□□ 1.21
SMKR1-201ENST00000462322 LANCL2Q9NS86 450 aa22.61■■□□□ 1.21
SMKR1-201ENST00000462322 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa22.61■■□□□ 1.21
SMKR1-201ENST00000462322 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa22.6■■□□□ 1.21
SMKR1-201ENST00000462322 K7EPI3 171 aa22.6■■□□□ 1.21
SMKR1-201ENST00000462322 CLEC3AO75596 197 aa22.6■■□□□ 1.21
SMKR1-201ENST00000462322 FHP07954 510 aa22.6■■□□□ 1.21
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