RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442406.5

EIF4G1-222, Transcript of eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1, human

TSL 1 (best)

Gene EIF4G1, Length 5,129 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EIF4G1-222	ENST00000442406	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	DIABLO	Q9NR28	239 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	CKLF	Q9UBR5	152 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406		A0A0J9YVX5	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	FAM92A	A1XBS5	289 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	TFPI	P10646	304 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	CD70	P32970	193 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	ADRA1A	P35348	466 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	HLCS	P50747	726 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	XKR4	Q5GH76	650 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	RPTN	Q6XPR3	784 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	MOAP1	Q96BY2	351 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	BOC	Q9BWV1	1114 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	COMMD9	Q9P000	198 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	FAM170B	A6NMN3	283 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	ARFIP1	P53367	373 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	DMPK	Q09013	629 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	LAPTM4A	Q15012	233 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	NDUFA5	Q16718	116 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	KLHL33	A6NCF5	533 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	CSF2RA	P15509	400 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	ELK4	P28324	431 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	COLEC12	Q5KU26	742 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	IQCH	Q86VS3	1027 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	NCSTN	Q92542	709 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
EIF4G1-222	ENST00000442406	SRC	P12931	536 aa		13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	MATN1	P21941	496 aa		13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	MNDA	P41218	407 aa		13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	SLC39A13	Q96H72	371 aa		13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	IL26	Q9NPH9	171 aa		13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	SMOX	Q9NWM0	555 aa		13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	AGRP	O00253	132 aa		13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	SOCS2	O14508	198 aa		13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	TGFBR2	P37173	567 aa		13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	TBPL1	P62380	186 aa		13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	RAB39A	Q14964	217 aa		13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	GPR68	Q15743	365 aa		13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	AVL9	Q8NBF6	648 aa		13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	OMA1	Q96E52	524 aa		13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	RNF6	Q9Y252	685 aa		13.71	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	COQ9	O75208	318 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	RCBTB2	O95199	551 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	SERPINA3	P01011	423 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	GPX3	P22352	226 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	RAB8A	P61006	207 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22	4e-10	■■■□□ 16.3
EIF4G1-222	ENST00000442406	KRT77	Q7Z794	578 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	TNF	P01375	233 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	MYF6	P23409	242 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	ADAM17	P78536	824 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	E2F2	Q14209	437 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	PON2	Q15165	354 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406	TTC34	A8MYJ7	566 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EIF4G1-222	ENST00000442406		H7BY64	318 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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