RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 KBTBD13C9JR72 458 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 G3V2L1 256 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 CTDSPLO15194 276 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 MLNRO43193 412 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 ACSL4O60488 711 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 SLU7O95391 586 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT3P12035 628 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 EDNRAP25101 427 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 PIK3R1P27986 724 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 OR3A3P47888 321 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 DHODHQ02127 395 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 LCLAT1Q6UWP7 414 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC22A15Q8IZD6 547 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 METTL4Q8N3J2 472 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP8B4Q8TF62 1192 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 LURAP1Q96LR2 239 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 ATG101Q9BSB4 218 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC61Q9BV99 259 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 NACAP1Q9BZK3 213 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 PDRG1Q9NUG6 133 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 VPS18Q9P253 973 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 GMEB2Q9UKD1 530 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 SATB2Q9UPW6 733 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 K7EQD1 137 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 TFECO14948 347 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 PGRMC2O15173 223 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 CRLF1O75462 422 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 NXPH4O95158 308 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT5P13647 590 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 BTG1P62324 171 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 CETN1Q12798 172 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 ABRQ12979 859 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 GRB14Q14449 540 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 PPA1Q15181 289 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 LPAL2Q16609 132 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 SNAI3Q3KNW1 292 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 SPANXN4Q5MJ08 99 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 C3P1Q6ZMU1 363 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 MACC1Q6ZN28 852 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 ZFAND4Q86XD8 727 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 TICAM2Q86XR7 235 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 TDHQ8IZJ6 230 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 TEX26Q8N6G2 289 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC185Q8N715 623 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 ATAD1Q8NBU5 361 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 SAP25Q8TEE9 199 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.21□□□□□ -1.98e-8■□□□□ 8.5
RABGGTB-202ENST00000370826 TMOD3Q9NYL9 352 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 SEPT10Q9P0V9 454 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR132Q9UNW8 380 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF123Q5XPI4 1314 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKDD1BA6NHY2 528 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 SDR42E2A6NKP2 422 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF732B4DXR9 585 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 H0Y626 953 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF103O00237 685 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 SCO2O43819 266 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 LRCH4O75427 683 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 C4BPBP20851 252 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 SRD5A2P31213 254 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT2P35908 639 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 IER3P46695 156 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 ENPP2Q13822 863 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 MEP1BQ16820 701 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF343Q6P1L6 599 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 PODNL1Q6PEZ8 512 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 NHLRC1Q6VVB1 395 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD23Q86SG2 305 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 GTSCR1Q86UQ5 136 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA0895Q8NCT3 520 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 OR10G7Q8NGN6 311 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 CD99L2Q8TCZ2 262 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 AFAP1L1Q8TED9 768 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC15Q8TF66 581 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-202ENST00000370826 CKAP2Q8WWK9 683 aa3.2□□□□□ -1.9
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