RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 ZYG11BQ9C0D3 744 aa16.06■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 STX16O14662 325 aa16.06■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 DPY19L1Q2PZI1 675 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 OR5M11Q96RB7 305 aa16.06■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 RP2O75695 350 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 OR5F1O95221 314 aa16.05■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 KCNH6Q9H252 994 aa16.05■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 MYO10Q9HD67 2058 aa16.05■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 HTR7P34969 479 aa16.05■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 BAK1Q16611 211 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 STX12Q86Y82 276 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 SAMD12Q8N8I0 201 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 TNFRSF1BP20333 461 aa16.05■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 SLAIN1Q8ND83 568 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 NEIL3Q8TAT5 605 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 NUDT8Q8WV74 236 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 SH3KBP1Q96B97 665 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 MRGPRX2Q96LB1 330 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 ATP13A1Q9HD20 1204 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa16.05■□□□□ 0.16
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