RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 F2RL3Q96RI0 385 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 UGT2B28Q9BY64 529 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM168Q9H0V1 697 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 GMEB1Q9Y692 573 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 AP4B1Q9Y6B7 739 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 LRP4O75096 1905 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 TRIOO75962 3097 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 TRBC2A0A5B9 178 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 RASGRP1O95267 797 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 RAP2AP10114 183 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 CKMT2P17540 419 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 NRF1Q16656 503 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 PPP4R4Q6NUP7 873 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 Q6ZSR6 202 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 CCL4L1Q8NHW4 92 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 SLC29A1Q99808 456 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 CYP8B1Q9UNU6 501 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 AK5Q9Y6K8 562 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 C1orf226A1L170 272 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 SAC3D1A6NKF1 404 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 CREG1O75629 220 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 SHMT2P34897 504 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 RABIFP47224 123 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 MC1RQ01726 317 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 CHRNB3Q05901 458 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 PAGE2Q7Z2X7 111 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 PACRGLQ8N7B6 248 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 TTLQ8NG68 377 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 SLC6A20Q9NP91 592 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 VPS4AQ9UN37 437 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-201ENST00000313173 NDUFS4O43181 175 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 CLEC3AO75596 197 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 CCNDBP1O95273 360 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 LDLRP01130 860 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 IL3P08700 152 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 PPIBP23284 216 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 BSGP35613 385 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 TCEA2Q15560 299 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 SLC30A9Q6PML9 568 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 EPHX4Q8IUS5 362 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF687Q8N1G0 1237 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 MARVELD2Q8N4S9 558 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 OR2L3Q8NG85 312 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 OR4A15Q8NGL6 344 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 QRFPRQ96P65 431 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 TPT1P8Q9HAU6 139 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM184CQ9NVA4 438 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 SPASTQ9UBP0 616 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 A6NCN8 305 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 C1QCP02747 245 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 CPZQ66K79 652 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 ERICH5Q6P6B1 374 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 SYNPOQ8N3V7 929 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 FBXO30Q8TB52 745 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 C9orf16Q9BUW7 83 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 SPHK1Q9NYA1 384 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 OR6C2Q9NZP2 312 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 DUSP12Q9UNI6 340 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 CORO2BQ9UQ03 480 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 COL6A3P12111 3177 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 SOCS2O14508 198 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 GAB1Q13480 694 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 PDK3Q15120 406 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 PLD3Q8IV08 490 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 FAM86B1Q8N7N1 296 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 OR13H1Q8NG92 308 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 LCN9Q8WX39 176 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 C8orf4Q9NR00 106 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 OLAHQ9NV23 265 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 DMTF1Q9Y222 760 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 C7orf72A4D263 438 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 GPR37L1O60883 481 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 MT-ND1P03886 318 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 LYNP07948 512 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 GRK3P35626 688 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 ENPP6Q6UWR7 440 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 AMIGO1Q86WK6 493 aa25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms