RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258772.9

DDX56-201, Transcript of DEAD-box helicase 56, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DDX56, Length 2,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX56-201ENST00000258772 CADM3Q8N126 398 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX56-201ENST00000258772 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX56-201ENST00000258772 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX56-201ENST00000258772 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
DDX56-201ENST00000258772 MCFD2Q8NI22 146 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX56-201ENST00000258772 GGHQ92820 318 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX56-201ENST00000258772 MYDGFQ969H8 173 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX56-201ENST00000258772 NEIL2Q969S2 332 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX56-201ENST00000258772 SAMD11Q96NU1 681 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX56-201ENST00000258772 PSD2Q9BQI7 771 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX56-201ENST00000258772 HEPHQ9BQS7 1158 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX56-201ENST00000258772 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
DDX56-201ENST00000258772 ANKHQ9HCJ1 492 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX56-201ENST00000258772 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
DDX56-201ENST00000258772 RLIMQ9NVW2 624 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX56-201ENST00000258772 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX56-201ENST00000258772 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX56-201ENST00000258772 CLCA1A8K7I4 914 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 AIREO43918 545 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 ATG13O75143 517 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 TNFRSF21O75509 655 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 ANXA8P13928 327 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 TIMP2P16035 220 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 UGT2B10P36537 528 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 PPP5CP53041 499 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 E2F2Q14209 437 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 ADIPOR2Q86V24 386 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 OR10G2Q8NGC3 310 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 OR52J3Q8NH60 311 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 CXorf40BQ96DE9 158 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 REEP4Q9H6H4 257 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 SPASTQ9UBP0 616 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 ALPK3Q96L96 1907 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 CDK1P06493 297 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 PDHA2P29803 388 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 OR1E2P47887 323 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 TIGD6Q17RP2 521 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 INAVAQ3KP66 663 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 IFI44LQ53G44 452 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 ARSIQ5FYB1 569 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 MED27Q6P2C8 311 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 OR4C15Q8NGM1 316 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 CORO1BQ9BR76 489 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 LAG3P18627 525 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 CTSKP43235 329 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 PRLHRP49683 370 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 CDH12P55289 794 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 ZNF763Q0D2J5 394 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 MICAQ29983 383 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 ZNF284Q2VY69 593 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 ZNF404Q494X3 552 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 GLYATL1Q969I3 302 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 VWCEQ96DN2 955 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 FOPNLQ96NB1 174 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 DACH2Q96NX9 599 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 MMP27Q9H306 513 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 POFUT2Q9Y2G5 429 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 CCDC88CQ9P219 2028 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 ZNF197O14709 1029 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 C6orf47O95873 294 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 GADD45AP24522 165 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 CD40LGP29965 261 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 MAGEA8P43361 318 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 IDH2P48735 452 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 SPIBQ01892 262 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 SCARB2Q14108 478 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 TMEM215Q68D42 235 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 OR52N2Q8NGI0 321 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 CREBZFQ9NS37 354 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 RAD18Q9NS91 495 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 TRIM17Q9Y577 477 aa14.63□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 GBAP04062 536 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 C8AP07357 584 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 GABRB1P18505 474 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 CCR2P41597 374 aa14.62□□□□□ -0.07
DDX56-201ENST00000258772 MC1RQ01726 317 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms