RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zscan5bB2RTN3 468 aa9.61□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P06324 132 aa9.61□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cox4i1P19783 169 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rps12P63323 132 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cep44Q5HZK1 386 aa9.61□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AbrQ5SSL4 859 aa9.61□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 RbfaQ6P3B9 350 aa9.61□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1307Q7TQX1 312 aa9.61□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm9758Q80ZT2 255 aa9.61□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MafaQ8CF90 359 aa9.61□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P3h2Q8CG71 703 aa9.61□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ifnl3Q8CGK6 193 aa9.61□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mapre2Q8R001 326 aa9.61□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp2c50Q91X77 490 aa9.61□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tspan1Q99J59 240 aa9.61□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ubqln5Q9D4I8 510 aa9.61□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 S100pbpQ9D5K4 396 aa9.61□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trip4Q9QXN3 581 aa9.61□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Scn8aQ9WTU3 1978 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm13276A0A087WR18 182 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adh6bA0A1D5RMB0 384 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1123A2AT85 323 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nt5c1aA3KFX0 365 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp277E9Q6D6 583 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr746E9Q840 314 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 S100a2J3QMC7 104 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lsm2O35900 95 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 DcnP28654 354 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Snrpd2P62317 118 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cntn5P68500 1098 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc30a10Q3UVU3 470 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ClpbQ60649 677 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Egfl8Q6GUQ1 293 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mfsd13aQ6PDE8 519 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmed3Q78IS1 221 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1085Q7TR64 313 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Glrx5Q80Y14 152 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mettl27Q8BGM4 238 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zbtb33Q8BN78 671 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 D2hgdhQ8CIM3 535 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam129bQ8R1F1 749 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ints14Q8R3P6 515 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 RhoqQ8R527 205 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r51Q8VIC6 319 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pramel1Q99MW3 458 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prps2Q9CS42 318 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Acbd7Q9D258 88 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ppa1Q9D819 289 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem37Q9JJV3 211 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cacng4Q9JJV4 327 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gbf1Q6DFZ1 1861 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gucy2dA0A0U1RPR8 1117 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp141G3UY09 685 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Aldh3b3J3QMK6 479 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8897L7N294 181 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Psmc3ipO35047 217 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cacng1O70578 223 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CcnkO88874 554 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp1P08042 402 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 DctP29812 517 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ArsbP50429 534 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc26a1P58735 704 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyb5r4Q3TDX8 528 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdkl4Q3TZA2 342 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arrdc3Q7TPQ9 414 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slco2b1Q8BXB6 683 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Psapl1Q8C1C1 522 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TrhdeQ8K093 1025 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc29a4Q8R139 528 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr437Q8VEV1 310 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sh3bp4Q921I6 962 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gbe1Q9D6Y9 702 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Wwp2Q9DBH0 870 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccdc107Q9DCC3 242 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mettl7bQ9DD20 244 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Capn10Q9ESK3 666 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Praf2Q9JIG8 178 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sema4gQ9WUH7 837 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 B3galt4Q9Z0F0 371 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CcniQ9Z2V9 377 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 RlfA2A7F4 1918 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kat6aQ8BZ21 2003 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trbc2A0A075B5J4 173 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trbc1A0A0A6YWV4 173 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vsig10lD3YZF7 868 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3149E9PW52 257 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm4775F7ANJ3 135 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp619G3X9T2 1161 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Calhm3J3QMI4 347 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TspearJ3S6Y1 670 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8362K7N6Y6 257 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ntf3P20181 258 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plin2P43883 425 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cav3P51637 151 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Eif4ebp2P70445 120 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Padi2Q08642 673 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mdga1Q0PMG2 940 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pin1rt1Q3ULQ2 159 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdk15Q3V3A1 433 aa9.6□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MarcoQ60754 518 aa9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.6 ms