RNA–Protein interactions for RNA: YJL004C

SYS1, Transcript of Integral membrane protein of the Golgi, yeast

Gene SYS1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYS1	YJL004C	HEM3	P28789	327 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	LST4	P34239	828 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	PUS9	Q12069	462 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	MXR1	P40029	184 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	MSE1	P48525	536 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	YAP6	Q03935	383 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	TAF7	Q05021	590 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	HMI1	Q12039	706 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	BI4	P03879	638 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	EMC1	P25574	760 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	LYP1	P32487	611 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	SLA2	P33338	968 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	GIS1	Q03833	894 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	YLR224W	Q05947	369 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	PNT1	P38969	423 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	YML020W	Q03722	664 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	NTO1	Q12311	748 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	RKM4	Q12504	494 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	PET112	P33893	541 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	MND2	P40577	368 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	HFM1	P51979	1187 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SYS1	YJL004C	DCG1	P32460	244 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	POA1	P38218	177 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	ZRG8	P40021	1076 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	AIM21	P40563	679 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	IOC3	P43596	787 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	MET12	P46151	657 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	GCV2	P49095	1034 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	TPO1	Q07824	586 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	INO1	P11986	533 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	CDC34	P14682	295 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	TYW3	P53177	273 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.07	□□□□□ -1.6	not detected
SYS1	YJL004C	OSW2	Q12202	724 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	ENA1	P13587	1091 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	YKL107W	P34251	309 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	MNR2	P35724	969 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	MET10	P39692	1035 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	ENA2	Q01896	1091 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	SPO20	Q04359	397 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	ADY3	Q07732	790 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	YLL058W	Q12198	575 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	ENA5	Q12691	1091 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	HIS5	P07172	385 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	DUT1	P33317	147 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	PLB1	P39105	664 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	SUN4	P53616	420 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	EEB1	Q02891	456 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	YAP1801	P38856	637 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	PHO23	P50947	330 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	CTF4	Q01454	927 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	YGL176C	P46945	554 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	MTC3	P53077	123 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	YPL066W	Q12194	479 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYS1	YJL004C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	CHA4	P43634	648 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	YGR012W	P53206	393 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	XYL2	Q07993	356 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	FUN30	P31380	1131 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.01	□□□□□ -1.61	not detected
SYS1	YJL004C	CCC2	P38995	1004 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	SLI1	P53304	468 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	MDM38	Q08179	573 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	HSF1	P10961	833 aa		5	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	EXG2	P52911	562 aa		5	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	SPE1	P08432	466 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	ATG19	P35193	415 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	CHS7	P38843	316 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	MSS4	P38994	779 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	KIN4	Q01919	800 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	SRT1	Q03175	343 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	CDA1	Q06702	301 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	AIM39	Q08223	395 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	RPC82	P32349	654 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	SRP101	P32916	621 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	YKL151C	P36059	337 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	GIC1	P38785	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SYS1	YJL004C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61

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