RNA–Protein interactions for RNA: YGR042W

YGR042W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YGR042W, Length 816 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGR042W	YGR042W	NTO1	Q12311	748 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YGR042W	YGR042W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YGR042W	YGR042W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YGR042W	YGR042W	SUN4	P53616	420 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YGR042W	YGR042W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YGR042W	YGR042W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YGR042W	YGR042W	RTT10	Q08924	1013 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YGR042W	YGR042W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YGR042W	YGR042W	BI4	P03879	638 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YGR042W	YGR042W	GEM1	P39722	662 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YGR042W	YGR042W	RRT14	P40470	206 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YGR042W	YGR042W	PHO23	P50947	330 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YGR042W	YGR042W	HFM1	P51979	1187 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YGR042W	YGR042W	SLI1	P53304	468 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YGR042W	YGR042W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YGR042W	YGR042W	PEP7	P32609	515 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YGR042W	YGR042W	SLA2	P33338	968 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YGR042W	YGR042W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	PNT1	P38969	423 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	MND2	P40577	368 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	DCG1	P32460	244 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	PLB1	P39105	664 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	AIM21	P40563	679 aa		5	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	TPO1	Q07824	586 aa		5	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	DUT1	P33317	147 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	MET12	P46151	657 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	MTC3	P53077	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	CTF4	Q01454	927 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	ADY3	Q07732	790 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	LYP1	P32487	611 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	POA1	P38218	177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
YGR042W	YGR042W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	XYL2	Q07993	356 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	HIS5	P07172	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	CHS7	P38843	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	RMD1	Q03441	430 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YGR042W	YGR042W	INO1	P11986	533 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	ENA1	P13587	1091 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	HEM3	P28789	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	MSS4	P38994	779 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	TYW3	P53177	273 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	KIN4	Q01919	800 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	EEB1	Q02891	456 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	YAP1801	P38856	637 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	CHA4	P43634	648 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	OSW2	Q12202	724 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	RKM4	Q12504	494 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	CDC34	P14682	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	YKL151C	P36059	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	EXG2	P52911	562 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	YML020W	Q03722	664 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	PET112	P33893	541 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	IOC3	P43596	787 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	YGL176C	P46945	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	RAD53	P22216	821 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	YKL107W	P34251	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	MET10	P39692	1035 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	YGR012W	P53206	393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	MDM38	Q08179	573 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	CDA1	Q06702	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YGR042W	YGR042W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	ASF1	P32447	279 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	SPE1	P08432	466 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	SRP101	P32916	621 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	GIC1	P38785	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	SRT1	Q03175	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	SPO20	Q04359	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	MNR2	P35724	969 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	YPT53	P36019	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	AIM39	Q08223	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	HSF1	P10961	833 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	FUN30	P31380	1131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	YGR053C	P53234	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	ESC2	Q06340	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	NPC2	Q12408	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	CCC2	P38995	1004 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	NCS6	P53088	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YGR042W	YGR042W	ENB1	Q08299	606 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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