RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637532.1

ARID1B-225, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5

Gene ARID1B, Length 445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-225	ENST00000637532	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	AKT1S1	Q96B36	256 aa		14.69	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	NECTIN2	Q92692	538 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	STK32B	Q9NY57	414 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	HOXB7	P09629	217 aa		14.67	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	SLC15A2	Q16348	729 aa		14.67	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	AK7	Q96M32	723 aa		14.67	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		14.67	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		14.66	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	RPS6KA4	O75676	772 aa		14.66	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	ZNF827	Q17R98	1081 aa		14.66	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		14.66	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	SMIM5	Q71RC9	77 aa		14.66	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		14.66	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		14.66	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	NBPF26	B4DH59	902 aa		14.65	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	GNPAT	O15228	680 aa		14.65	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		14.65	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		14.65	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	NBPF15	Q8N660	670 aa		14.65	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		14.65	□□□□□ -0.06
ARID1B-225	ENST00000637532	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	PDIA6	Q15084	440 aa		14.64	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	MYL6B	P14649	208 aa		14.63	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		14.63	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	ARX	Q96QS3	562 aa		14.63	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	ANXA1	P04083	346 aa		14.62	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	PROSER3	Q2NL68	480 aa		14.62	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		14.62	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	14.62	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		14.62	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	PHF14	O94880	888 aa		14.61	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	SLC4A2	P04920	1241 aa		14.61	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	SSFA2	P28290	1259 aa		14.61	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	ERBB4	Q15303	1308 aa		14.61	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	RFC4	P35249	363 aa		14.6	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	STK31	Q9BXU1	1019 aa		14.6	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	HYPK	Q9NX55	129 aa		14.6	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		14.6	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	PAPPA	Q13219	1627 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	LY75	O60449	1722 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532		A0A087WZG4	1122 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	COPS6	Q7L5N1	327 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	ZNF428	Q96B54	188 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ARID1B-225	ENST00000637532	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	ZPR1	O75312	459 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	G2E3	Q7L622	706 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	NARF	Q9UHQ1	456 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	RNF39	Q9H2S5	420 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	CAMTA2	O94983	1202 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	C4B	P0C0L5	1744 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	COL15A1	P39059	1388 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ARID1B-225	ENST00000637532	BCAR3	O75815	825 aa		14.53	□□□□□ -0.08

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