RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.75■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.75■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 STARD3NLO95772 234 aa22.74■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 DCTN1Q14203 1278 aa22.74■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 KLHL34Q8N239 644 aa22.73■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.73■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.73■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 MMP10P09238 476 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 UTRNP46939 3433 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.71■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 KCNQ3O43525 872 aa22.7■■□□□ 1.22
HERC3-214ENST00000601319 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
HERC3-214ENST00000601319 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
HERC3-214ENST00000601319 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
HERC3-214ENST00000601319 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
HERC3-214ENST00000601319 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
HERC3-214ENST00000601319 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.67■■□□□ 1.22
HERC3-214ENST00000601319 RUNDC1Q96C34 613 aa22.67■■□□□ 1.22
HERC3-214ENST00000601319 NARFQ9UHQ1 456 aa22.67■■□□□ 1.22
HERC3-214ENST00000601319 ZPR1O75312 459 aa22.66■■□□□ 1.22
HERC3-214ENST00000601319 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HERC3-214ENST00000601319 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HERC3-214ENST00000601319 A0A087WZG4 1122 aa22.65■■□□□ 1.22
HERC3-214ENST00000601319 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HERC3-214ENST00000601319 RIPK4P57078 832 aa22.65■■□□□ 1.22
HERC3-214ENST00000601319 FKBP8Q14318 412 aa22.65■■□□□ 1.22
HERC3-214ENST00000601319 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.65■■□□□ 1.22
HERC3-214ENST00000601319 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.65■■□□□ 1.22
HERC3-214ENST00000601319 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.65■■□□□ 1.22
HERC3-214ENST00000601319 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.64■■□□□ 1.21
HERC3-214ENST00000601319 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
HERC3-214ENST00000601319 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.63■■□□□ 1.21
HERC3-214ENST00000601319 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.63■■□□□ 1.21
HERC3-214ENST00000601319 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.62■■□□□ 1.21
HERC3-214ENST00000601319 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.62■■□□□ 1.21
HERC3-214ENST00000601319 TM4SF1P30408 202 aa22.61■■□□□ 1.21
HERC3-214ENST00000601319 DDR1Q08345 913 aa22.61■■□□□ 1.21
HERC3-214ENST00000601319 GPR162Q16538 588 aa22.61■■□□□ 1.21
HERC3-214ENST00000601319 USP16Q9Y5T5 823 aa22.61■■□□□ 1.21
HERC3-214ENST00000601319 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.6■■□□□ 1.21
HERC3-214ENST00000601319 A1BGP04217 495 aa22.6■■□□□ 1.21
HERC3-214ENST00000601319 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.6■■□□□ 1.21
HERC3-214ENST00000601319 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.6■■□□□ 1.21
HERC3-214ENST00000601319 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HERC3-214ENST00000601319 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.58■■□□□ 1.21
HERC3-214ENST00000601319 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HERC3-214ENST00000601319 TGFB2P61812 414 aa22.58■■□□□ 1.21
HERC3-214ENST00000601319 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.57■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 YY1P25490 414 aa22.56■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 NFIXQ14938 502 aa22.56■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.56■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 NUP98P52948 1817 aa22.56■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 RGL2O15211 777 aa22.55■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 ANP32CO43423 234 aa22.55■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 GRIN3BO60391 1043 aa22.55■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 NBPF26B4DH59 902 aa22.54■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 CAMTA2O94983 1202 aa22.54■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 NBPF15Q8N660 670 aa22.54■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 NEUROD2Q15784 382 aa22.53■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.53■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 ERBB4Q15303 1308 aa22.53■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.52■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 CCDC184Q52MB2 194 aa22.52■■□□□ 1.2
HERC3-214ENST00000601319 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
HERC3-214ENST00000601319 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.5■■□□□ 1.19
HERC3-214ENST00000601319 CHL1O00533 1208 aa22.5■■□□□ 1.19
HERC3-214ENST00000601319 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.5■■□□□ 1.19
HERC3-214ENST00000601319 SERPINB2P05120 415 aa22.49■■□□□ 1.19
HERC3-214ENST00000601319 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.49■■□□□ 1.19
HERC3-214ENST00000601319 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.49■■□□□ 1.19
HERC3-214ENST00000601319 A0A0G2JLW4 131 aa22.48■■□□□ 1.19
HERC3-214ENST00000601319 APAF1O14727 1248 aa22.48■■□□□ 1.19
HERC3-214ENST00000601319 DPEP1P16444 411 aa22.48■■□□□ 1.19
HERC3-214ENST00000601319 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.48■■□□□ 1.19
HERC3-214ENST00000601319 MRS2Q9HD23 443 aa22.47■■□□□ 1.19
HERC3-214ENST00000601319 KCNA3P22001 575 aa22.46■■□□□ 1.19
HERC3-214ENST00000601319 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
HERC3-214ENST00000601319 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.45■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 CFAP44Q96MT7 982 aa22.45■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 CACNA1SQ13698 1873 aa22.44■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 SETDB2Q96T68 719 aa22.44■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 ATP10DQ9P241 1426 aa22.44■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 HOXB7P09629 217 aa22.43■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 ZNF853P0CG23 659 aa22.43■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 PIM2Q9P1W9 311 aa22.43■■□□□ 1.18
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