RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 NRAPQ86VF7 1730 aa8.04□□□□□ -1.12
CAPNS1-208ENST00000589162 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.04□□□□□ -1.12
CAPNS1-208ENST00000589162 PDE4AP27815 886 aa8.04□□□□□ -1.12
CAPNS1-208ENST00000589162 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CAPNS1-208ENST00000589162 BTG4Q9NY30 223 aa8.04□□□□□ -1.12
CAPNS1-208ENST00000589162 RTL1A6NKG5 1358 aa8.04□□□□□ -1.12
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CAPNS1-208ENST00000589162 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CAPNS1-208ENST00000589162 PRKAR2BP31323 418 aa8.03□□□□□ -1.12
CAPNS1-208ENST00000589162 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CAPNS1-208ENST00000589162 SULT6B1Q6IMI4 303 aa8.03□□□□□ -1.12
CAPNS1-208ENST00000589162 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.03□□□□□ -1.12
CAPNS1-208ENST00000589162 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.03□□□□□ -1.12
CAPNS1-208ENST00000589162 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.03□□□□□ -1.12
CAPNS1-208ENST00000589162 USP35Q9P2H5 1018 aa8.03□□□□□ -1.12
CAPNS1-208ENST00000589162 EVA1CP58658 441 aa8.02□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.02□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 NEUROD2Q15784 382 aa8.02□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 NGLY1Q96IV0 654 aa8.02□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 PHACTR3Q96KR7 559 aa8.02□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.02□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 NUDCQ9Y266 331 aa8.02□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa8.02□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 IGSF1Q8N6C5 1336 aa8.02□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP3K9P80192 1104 aa8.01□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa8.01□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 LRCH3Q96II8 777 aa8.01□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.01□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF24Q5T7B8 1368 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 MEGF6O75095 1541 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 SLIT2O94813 1529 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 APAF1O14727 1248 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 TYW1BQ6NUM6 668 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHF1Q96S99 279 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 AFF2P51816 1311 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR17Q8IZU2 1322 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCC6O95255 1503 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 RGL2O15211 777 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 PROX2Q3B8N5 592 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 TCP11L2Q8N4U5 519 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 RUNDC1Q96C34 613 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 NWD2Q9ULI1 1742 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 DLG5Q8TDM6 1919 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 BCL9LQ86UU0 1499 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 CRB1P82279 1406 aa7.98□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 PHF14O94880 888 aa7.98□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 DCTN1Q14203 1278 aa7.98□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 USP21Q9UK80 565 aa7.98□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 NCAPD2Q15021 1401 aa7.97□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 WNK3Q9BYP7 1800 aa7.97□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 FCHSD2O94868 740 aa7.97□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 UNC5CLQ8IV45 518 aa7.97□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.97□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.97□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.97□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 GLI3P10071 1580 aa7.97□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 KDRP35968 1356 aa7.97□□□□□ -1.13
CAPNS1-208ENST00000589162 SHANK3Q9BYB0 1731 aa7.96□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 TMPOP42166 694 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP4CP60510 307 aa7.96□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 HS6ST3Q8IZP7 471 aa7.96□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.96□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.96□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.96□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa7.96□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 COL9A1P20849 921 aa7.95□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 GGCXP38435 758 aa7.95□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 RIPK4P57078 832 aa7.95□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 NFE2L2Q16236 605 aa7.95□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa7.95□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 EPAS1Q99814 870 aa7.95□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa7.95□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa7.95□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 PKD1L3Q7Z443 1732 aa7.95□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 DISP2A7MBM2 1401 aa7.95□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC37A3O60309 1634 aa7.94□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 IL2RBP14784 551 aa7.94□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 MYT1Q01538 1121 aa7.94□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 VPS72Q15906 364 aa7.94□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM182BQ5T319 152 aa7.94□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 MCM10Q7L590 875 aa7.94□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 IL21Q9HBE4 155 aa7.94□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.94□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 ATRNO75882 1429 aa7.94□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.93□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
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