RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588707.5

GTF3C2-AS1-205, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 607 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RNF123Q5XPI4 1314 aa9.45□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa9.45□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF831Q5JPB2 1677 aa9.45□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SCN11AQ9UI33 1791 aa9.45□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RPS6KA4O75676 772 aa9.44□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GNAI1P63096 354 aa9.44□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SLC39A6Q13433 755 aa9.44□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FKBP8Q14318 412 aa9.44□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IFT57Q9NWB7 429 aa9.44□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MRC1P22897 1456 aa9.44□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 UTRNP46939 3433 aa9.44□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CRKLP46109 303 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DNAJC10Q8IXB1 793 aa9.43□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF428Q96B54 188 aa9.43□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CD2APQ9Y5K6 639 aa9.43□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa9.42□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GNAT3A8MTJ3 354 aa9.42□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ADRA2BP18089 450 aa9.42□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RFC4P35249 363 aa9.42□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RRP1P56182 461 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IL17REQ8NFR9 667 aa9.42□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CFAP44Q96MT7 982 aa9.42□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TJP1Q07157 1748 aa9.42□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MMP10P09238 476 aa9.41□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GYS1P13807 737 aa9.41□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP9.41□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NLGN1Q8N2Q7 840 aa9.41□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KCPQ6ZWJ8 1503 aa9.41□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FANCIQ9NVI1 1328 aa9.4□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TEFQ10587 303 aa9.4□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TTC5Q8N0Z6 440 aa9.4□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CCDC87Q9NVE4 849 aa9.4□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BABAM1Q9NWV8 329 aa9.4□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.4□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF853P0CG23 659 aa9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GRIN3BO60391 1043 aa9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MS4A1P11836 297 aa9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF790Q6PG37 636 aa9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CHMP4AQ9BY43 222 aa9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C4AP0C0L4 1744 aa9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BTBD11A6QL63 1104 aa9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CHL1O00533 1208 aa9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KCNQ3O43525 872 aa9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CANXP27824 592 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RARSP54136 660 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ALDH1L2Q3SY69 923 aa9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MCM10Q7L590 875 aa9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MBIPQ9NS73 344 aa9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 UBR2Q8IWV8 1755 aa9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 COL15A1P39059 1388 aa9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HEG1Q9ULI3 1381 aa9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PXDNLA1KZ92 1463 aa9.36□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZPR1O75312 459 aa9.36□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DDR1Q08345 913 aa9.36□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DCTN1Q14203 1278 aa9.36□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PDE3AQ14432 1141 aa9.36□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FMNL2Q96PY5 1086 aa9.36□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C10orf71Q711Q0 1435 aa9.36□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KIF16BQ96L93 1317 aa9.35□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A0A0G2JLW4 131 aa9.35□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 STARD3NLO95772 234 aa9.35□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TM4SF1P30408 202 aa9.35□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TGFB2P61812 414 aa9.35□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NARFQ9UHQ1 456 aa9.35□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TSPYL4Q9UJ04 414 aa9.35□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DLG5Q8TDM6 1919 aa9.35□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DPEP1P16444 411 aa9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 EIF5P55010 431 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms