RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 ATF3P18847 181 aa28.43■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 TMEM94Q12767 1356 aa28.43■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa28.42■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 SRGAP3O43295 1099 aa28.42■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 SURF6O75683 361 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa28.42■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 COL18A1P39060 1754 aa28.41■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.41■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 DCCP43146 1447 aa28.41■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 PROSER3Q2NL68 480 aa28.41■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 SCN11AQ9UI33 1791 aa28.41■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa28.4■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 GBP4Q96PP9 640 aa28.4■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 CHMLP26374 656 aa28.4■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 RILPL2Q969X0 211 aa28.4■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa28.39■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 RHPN1Q8TCX5 695 aa28.39■■■□□ 2.14
EHD4-202ENST00000569223 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.38■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 ST18O60284 1047 aa28.38■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.38■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 ALDH1L1O75891 902 aa28.37■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 KSR2Q6VAB6 950 aa28.37■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.37■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 AK9Q5TCS8 1911 aa28.37■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.36■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 KIF1BPQ96EK5 621 aa28.36■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.36■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 ABCC6O95255 1503 aa28.36■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 HYPKQ9NX55 129 aa28.35■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 SSFA2P28290 1259 aa28.35■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 C5P01031 1676 aa28.34■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 MTX1Q13505 466 aa28.34■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 MEGF6O75095 1541 aa28.34■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa28.33■■■□□ 2.13
EHD4-202ENST00000569223 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.32■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 PI4K2BQ8TCG2 481 aa28.32■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.32■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.31■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 PHKG2P15735 406 aa28.31■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 PTMSP20962 102 aa28.3■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 MCCP23508 829 aa28.3■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 ZNF790Q6PG37 636 aa28.3■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 CLEC17AQ6ZS10 378 aa28.3■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 SPG7Q9UQ90 795 aa28.3■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 FSD2A1L4K1 749 aa28.3■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 PDIA6Q15084 440 aa28.3■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 ANO2Q9NQ90 1003 aa28.3■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 SLC39A6Q13433 755 aa28.29■■■□□ 2.12
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EHD4-202ENST00000569223 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.28■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa28.28■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.28■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 ANAPC15P60006 121 aa28.27■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 LINS1Q8NG48 757 aa28.27■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 PALD1Q9ULE6 856 aa28.27■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 HDAC5Q9UQL6 1122 aa28.27■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.27■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.26■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 NUCB2P80303 420 aa28.26■■■□□ 2.12
EHD4-202ENST00000569223 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.26■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 MRC1P22897 1456 aa28.25■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 NEK4P51957 841 aa28.25■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.25■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 IL17RAQ96F46 866 aa28.25■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 UTYO14607 1347 aa28.25■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 CHRNA2Q15822 529 aa28.25■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.25■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 IL25Q9H293 177 aa28.25■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 GRM8O00222 908 aa28.23■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 BAG4O95429 457 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.23■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 TTC41PQ6P2S7 1318 aa28.23■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 CNTROBQ8N137 903 aa28.22■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 MCM2P49736 904 aa28.21■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 SUCLG2Q96I99 432 aa28.21■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 GOLGA6L22H0YM25 854 aa28.2■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 KAZALD1Q96I82 304 aa28.2■■■□□ 2.11
EHD4-202ENST00000569223 CPDO75976 1380 aa28.2■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.19■■■□□ 2.1
EHD4-202ENST00000569223 ERC1Q8IUD2 1116 aa28.19■■■□□ 2.1
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