RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.63■■□□□ 1.53
CTU2-204ENST00000564105 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.62■■□□□ 1.53
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CTU2-204ENST00000564105 USP16Q9Y5T5 823 aa24.62■■□□□ 1.53
CTU2-204ENST00000564105 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.61■■□□□ 1.53
CTU2-204ENST00000564105 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.61■■□□□ 1.53
CTU2-204ENST00000564105 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.61■■□□□ 1.53
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CTU2-204ENST00000564105 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
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CTU2-204ENST00000564105 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.59■■□□□ 1.53
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CTU2-204ENST00000564105 BCAR3O75815 825 aa24.58■■□□□ 1.52
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CTU2-204ENST00000564105 SLC4A2P04920 1241 aa24.54■■□□□ 1.52
CTU2-204ENST00000564105 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
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CTU2-204ENST00000564105 ERBB4Q15303 1308 aa24.52■■□□□ 1.52
CTU2-204ENST00000564105 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
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CTU2-204ENST00000564105 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.52■■□□□ 1.52
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CTU2-204ENST00000564105 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.51
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CTU2-204ENST00000564105 PDIA6Q15084 440 aa24.5■■□□□ 1.51
CTU2-204ENST00000564105 KIF16BQ96L93 1317 aa24.5■■□□□ 1.51
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CTU2-204ENST00000564105 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.5■■□□□ 1.51
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CTU2-204ENST00000564105 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.49■■□□□ 1.51
CTU2-204ENST00000564105 MYL6BP14649 208 aa24.49■■□□□ 1.51
CTU2-204ENST00000564105 TXNRD1Q16881 649 aa24.49■■□□□ 1.51
CTU2-204ENST00000564105 PROSER3Q2NL68 480 aa24.49■■□□□ 1.51
CTU2-204ENST00000564105 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.49■■□□□ 1.51
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CTU2-204ENST00000564105 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.49■■□□□ 1.51
CTU2-204ENST00000564105 NUP98P52948 1817 aa24.48■■□□□ 1.51
CTU2-204ENST00000564105 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
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CTU2-204ENST00000564105 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.46■■□□□ 1.51
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CTU2-204ENST00000564105 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
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CTU2-204ENST00000564105 FLIIQ13045 1269 aa24.45■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 CASZ1Q86V15 1759 aa24.44■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.44■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.44■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 C4AP0C0L4 1744 aa24.44■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 PTPRCP08575 1304 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.43■■□□□ 1.5
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CTU2-204ENST00000564105 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 ARHGAP45Q92619 1136 aa24.42■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 BCORQ6W2J9 1755 aa24.42■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
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CTU2-204ENST00000564105 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.41■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.41■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 COPS6Q7L5N1 327 aa24.4■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.39■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 TRIM27P14373 513 aa24.39■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
CTU2-204ENST00000564105 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 TNNQ9UQP3 1299 aa24.38■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 AK7Q96M32 723 aa24.37■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 GNPATO15228 680 aa24.37■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.37■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 RPS6KA4O75676 772 aa24.36■■□□□ 1.49
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