RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559277.1

TMC3-AS1-202, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMC3-AS1, Length 479 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-202ENST00000559277 KIF24Q5T7B8 1368 aa16.39■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 AIDAQ96BJ3 306 aa16.39■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 EYA1Q99502 592 aa16.39■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa16.39■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa16.39■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CRKLP46109 303 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CCDC85CA6NKD9 419 aa16.37■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 DDNO94850 711 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CARMIL3Q8ND23 1372 aa16.36■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 DPY19L2Q6NUT2 758 aa16.35■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TTLL6Q8N841 843 aa16.35■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa16.35■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ERVV-2B6SEH9 535 aa16.34■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 NEUROD1Q13562 356 aa16.34■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 NFIXQ14938 502 aa16.34■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 USPL1Q5W0Q7 1092 aa16.34■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa16.33■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TMEM88BA6NKF7 163 aa16.33■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ERFEQ4G0M1 354 aa16.33■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 BCL2L12Q9HB09 334 aa16.32■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SCN4AP35499 1836 aa16.31■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 C2CD5Q86YS7 1000 aa16.31■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 THSD7BQ9C0I4 1608 aa16.3■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 WASHC2AQ641Q2 1341 aa16.3■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RASSF10A6NK89 507 aa16.3■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa16.29■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SERPINB2P05120 415 aa16.29■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 LDHDQ86WU2 507 aa16.29■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 C21orf2O43822 256 aa16.28■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 DEFB115Q30KQ5 88 aa16.28■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CACNA1SQ13698 1873 aa16.27■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SLX4Q8IY92 1834 aa16.27■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CABP4P57796 275 aa16.27■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CARD14Q9BXL6 1004 aa16.27■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 H0YIN7 160 aa16.26■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ZPR1O75312 459 aa16.26■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 NARFQ9UHQ1 456 aa16.26■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 LTBP1Q14766 1721 aa16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 LTBP3Q9NS15 1303 aa16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 DNAJC10Q8IXB1 793 aa16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TSKSQ9UJT2 592 aa16.24■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CCDC24Q8N4L8 307 aa16.23■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TAOK3Q9H2K8 898 aa16.23■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 POLKQ9UBT6 870 aa16.23■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 IQCA1LA6NCM1 817 aa16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 COL15A1P39059 1388 aa16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa16.22■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ZNF541Q9H0D2 1346 aa16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 MCOLN1Q9GZU1 580 aa16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa16.21■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CNTROBQ8N137 903 aa16.2■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 MTHFSP49914 203 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 BICDL1Q6ZP65 573 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CFAP44Q96MT7 982 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.19■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CAPNS2Q96L46 248 aa16.18■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 EPHX2P34913 555 aa16.17■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TBC1D9BQ66K14 1250 aa16.17■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PRR5LQ6MZQ0 368 aa16.17■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CYP4F22Q6NT55 531 aa16.17■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 BRIP1Q9BX63 1249 aa16.17■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 HACL1Q9UJ83 578 aa16.16■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RNF123Q5XPI4 1314 aa16.16■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 AOC2O75106 756 aa16.15■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 AEBP1Q8IUX7 1158 aa16.15■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 C7orf43Q8WVR3 580 aa16.15■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SCN7AQ01118 1682 aa16.14■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TRPM7Q96QT4 1865 aa16.14■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PDE6BP35913 854 aa16.14■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SLC39A6Q13433 755 aa16.14■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CST9Q5W186 159 aa16.14■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-202ENST00000559277 GRM1Q13255 1194 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms