RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557484.5

GABRA5-211, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha5 subunit, human

TSL 5

Gene GABRA5, Length 506 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GABRA5-211	ENST00000557484	ZPR1	O75312	459 aa		40.42	■■■■■ 4.06
GABRA5-211	ENST00000557484	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		40.42	■■■■■ 4.06
GABRA5-211	ENST00000557484	NARF	Q9UHQ1	456 aa		40.4	■■■■■ 4.06
GABRA5-211	ENST00000557484	KCNQ3	O43525	872 aa		40.39	■■■■■ 4.06
GABRA5-211	ENST00000557484	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		40.39	■■■■■ 4.06
GABRA5-211	ENST00000557484	COL15A1	P39059	1388 aa		40.38	■■■■■ 4.06
GABRA5-211	ENST00000557484		A0A087WZG4	1122 aa		40.38	■■■■■ 4.05
GABRA5-211	ENST00000557484	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	40.38	■■■■■ 4.05
GABRA5-211	ENST00000557484	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	40.38	■■■■■ 4.05
GABRA5-211	ENST00000557484	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	40.37	■■■■■ 4.05
GABRA5-211	ENST00000557484	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	40.37	■■■■■ 4.05
GABRA5-211	ENST00000557484	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	40.37	■■■■■ 4.05
GABRA5-211	ENST00000557484	YY1	P25490	414 aa		40.35	■■■■■ 4.05
GABRA5-211	ENST00000557484	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	40.35	■■■■■ 4.05
GABRA5-211	ENST00000557484	GRIN3B	O60391	1043 aa		40.34	■■■■■ 4.05
GABRA5-211	ENST00000557484	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	40.34	■■■■■ 4.05
GABRA5-211	ENST00000557484	FKBP8	Q14318	412 aa		40.34	■■■■■ 4.05
GABRA5-211	ENST00000557484	TM4SF1	P30408	202 aa		40.32	■■■■■ 4.05
GABRA5-211	ENST00000557484	TGFB2	P61812	414 aa		40.32	■■■■■ 4.05
GABRA5-211	ENST00000557484	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		40.32	■■■■■ 4.05
GABRA5-211	ENST00000557484	RIPK4	P57078	832 aa		40.31	■■■■■ 4.04
GABRA5-211	ENST00000557484	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		40.31	■■■■■ 4.04
GABRA5-211	ENST00000557484	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		40.3	■■■■■ 4.04
GABRA5-211	ENST00000557484	CHD4	Q14839	1912 aa		40.3	■■■■■ 4.04
GABRA5-211	ENST00000557484	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	40.3	■■■■■ 4.04
GABRA5-211	ENST00000557484	RUNDC1	Q96C34	613 aa		40.3	■■■■■ 4.04
GABRA5-211	ENST00000557484	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	40.29	■■■■■ 4.04
GABRA5-211	ENST00000557484	USP16	Q9Y5T5	823 aa		40.28	■■■■■ 4.04
GABRA5-211	ENST00000557484	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	40.27	■■■■■ 4.04
GABRA5-211	ENST00000557484	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		40.27	■■■■■ 4.04
GABRA5-211	ENST00000557484	A1BG	P04217	495 aa		40.26	■■■■■ 4.04
GABRA5-211	ENST00000557484	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		40.26	■■■■■ 4.04
GABRA5-211	ENST00000557484	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		40.25	■■■■■ 4.03
GABRA5-211	ENST00000557484	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		40.23	■■■■■ 4.03
GABRA5-211	ENST00000557484	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	40.22	■■■■■ 4.03
GABRA5-211	ENST00000557484	DDR1	Q08345	913 aa		40.22	■■■■■ 4.03
GABRA5-211	ENST00000557484	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		40.22	■■■■■ 4.03
GABRA5-211	ENST00000557484	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		40.21	■■■■■ 4.03
GABRA5-211	ENST00000557484	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
GABRA5-211	ENST00000557484	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
GABRA5-211	ENST00000557484	UTRN	P46939	3433 aa		40.2	■■■■■ 4.03
GABRA5-211	ENST00000557484	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	40.19	■■■■■ 4.02
GABRA5-211	ENST00000557484	NFIX	Q14938	502 aa		40.19	■■■■■ 4.02
GABRA5-211	ENST00000557484	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		40.18	■■■■■ 4.02
GABRA5-211	ENST00000557484	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		40.17	■■■■■ 4.02
GABRA5-211	ENST00000557484	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	40.17	■■■■■ 4.02
GABRA5-211	ENST00000557484	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		40.15	■■■■■ 4.02
GABRA5-211	ENST00000557484	RGL2	O15211	777 aa		40.15	■■■■■ 4.02
GABRA5-211	ENST00000557484	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		40.15	■■■■■ 4.02
GABRA5-211	ENST00000557484	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	40.15	■■■■■ 4.02
GABRA5-211	ENST00000557484	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		40.13	■■■■■ 4.01
GABRA5-211	ENST00000557484	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	40.12	■■■■■ 4.01
GABRA5-211	ENST00000557484	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		40.11	■■■■■ 4.01
GABRA5-211	ENST00000557484	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	40.11	■■■■■ 4.01
GABRA5-211	ENST00000557484	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		40.11	■■■■■ 4.01
GABRA5-211	ENST00000557484		A0A0G2JLW4	131 aa		40.1	■■■■■ 4.01
GABRA5-211	ENST00000557484	CAMTA2	O94983	1202 aa		40.1	■■■■■ 4.01
GABRA5-211	ENST00000557484	SERPINB2	P05120	415 aa		40.1	■■■■■ 4.01
GABRA5-211	ENST00000557484	NEUROD2	Q15784	382 aa		40.09	■■■■■ 4.01
GABRA5-211	ENST00000557484	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		40.09	■■■■■ 4.01
GABRA5-211	ENST00000557484	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	40.09	■■■■■ 4.01
GABRA5-211	ENST00000557484	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		40.08	■■■■■ 4.01
GABRA5-211	ENST00000557484	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		40.08	■■■■■ 4.01
GABRA5-211	ENST00000557484	NBPF26	B4DH59	902 aa		40.08	■■■■■ 4.01
GABRA5-211	ENST00000557484	DPEP1	P16444	411 aa		40.08	■■■■■ 4.01
GABRA5-211	ENST00000557484	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	40.08	■■■■■ 4.01
GABRA5-211	ENST00000557484	NBPF15	Q8N660	670 aa		40.08	■■■■■ 4.01
GABRA5-211	ENST00000557484	SCN7A	Q01118	1682 aa		40.08	■■■■■ 4.01
GABRA5-211	ENST00000557484	ANP32C	O43423	234 aa		40.07	■■■■■ 4.01
GABRA5-211	ENST00000557484	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	40.06	■■■■■ 4
GABRA5-211	ENST00000557484	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	40.06	■■■■■ 4
GABRA5-211	ENST00000557484	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		40.05	■■■■■ 4
GABRA5-211	ENST00000557484	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		40.05	■■■■■ 4
GABRA5-211	ENST00000557484	KCNA3	P22001	575 aa		40.04	■■■■■ 4
GABRA5-211	ENST00000557484	PIM2	Q9P1W9	311 aa		40.04	■■■■■ 4
GABRA5-211	ENST00000557484	ERBB4	Q15303	1308 aa		40.04	■■■■■ 4
GABRA5-211	ENST00000557484	CHL1	O00533	1208 aa		40.03	■■■■■ 4
GABRA5-211	ENST00000557484	SETDB2	Q96T68	719 aa		40.03	■■■■■ 4
GABRA5-211	ENST00000557484	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	40.02	■■■■■ 4
GABRA5-211	ENST00000557484	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		40.01	■■■■■ 4
GABRA5-211	ENST00000557484	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		40.01	■■■■■ 4
GABRA5-211	ENST00000557484	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		40	■■■■□ 3.99
GABRA5-211	ENST00000557484	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	40	■■■■□ 3.99
GABRA5-211	ENST00000557484	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		40	■■■■□ 3.99
GABRA5-211	ENST00000557484	BCS1L	Q9Y276	419 aa		39.99	■■■■□ 3.99
GABRA5-211	ENST00000557484	APAF1	O14727	1248 aa		39.97	■■■■□ 3.99
GABRA5-211	ENST00000557484	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	39.97	■■■■□ 3.99
GABRA5-211	ENST00000557484	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	39.96	■■■■□ 3.99
GABRA5-211	ENST00000557484	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		39.95	■■■■□ 3.99
GABRA5-211	ENST00000557484	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	39.95	■■■■□ 3.99
GABRA5-211	ENST00000557484	CFAP44	Q96MT7	982 aa		39.95	■■■■□ 3.99
GABRA5-211	ENST00000557484	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		39.95	■■■■□ 3.99
GABRA5-211	ENST00000557484	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		39.94	■■■■□ 3.98
GABRA5-211	ENST00000557484	CCDC184	Q52MB2	194 aa		39.93	■■■■□ 3.98
GABRA5-211	ENST00000557484	CHRNA5	P30532	468 aa		39.91	■■■■□ 3.98
GABRA5-211	ENST00000557484	PDE6B	P35913	854 aa		39.91	■■■■□ 3.98
GABRA5-211	ENST00000557484	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		39.91	■■■■□ 3.98
GABRA5-211	ENST00000557484		H0YIN7	160 aa		39.9	■■■■□ 3.98
GABRA5-211	ENST00000557484	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		39.9	■■■■□ 3.98
GABRA5-211	ENST00000557484	CNBD1	Q8NA66	436 aa		39.89	■■■■□ 3.98

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