RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549279.1

TPCN1-212, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 4

Gene TPCN1, Length 544 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-212ENST00000549279 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.55■■□□□ 1.84
TPCN1-212ENST00000549279 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.55■■□□□ 1.84
TPCN1-212ENST00000549279 RUNDC1Q96C34 613 aa26.55■■□□□ 1.84
TPCN1-212ENST00000549279 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.55■■□□□ 1.84
TPCN1-212ENST00000549279 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
TPCN1-212ENST00000549279 MMP10P09238 476 aa26.54■■□□□ 1.84
TPCN1-212ENST00000549279 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
TPCN1-212ENST00000549279 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.54■■□□□ 1.84
TPCN1-212ENST00000549279 COL15A1P39059 1388 aa26.54■■□□□ 1.84
TPCN1-212ENST00000549279 ANP32CO43423 234 aa26.53■■□□□ 1.84
TPCN1-212ENST00000549279 ZPR1O75312 459 aa26.53■■□□□ 1.84
TPCN1-212ENST00000549279 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
TPCN1-212ENST00000549279 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
TPCN1-212ENST00000549279 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
TPCN1-212ENST00000549279 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
TPCN1-212ENST00000549279 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.5■■□□□ 1.83
TPCN1-212ENST00000549279 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.5■■□□□ 1.83
TPCN1-212ENST00000549279 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.49■■□□□ 1.83
TPCN1-212ENST00000549279 A0A087WZG4 1122 aa26.49■■□□□ 1.83
TPCN1-212ENST00000549279 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
TPCN1-212ENST00000549279 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.49■■□□□ 1.83
TPCN1-212ENST00000549279 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
TPCN1-212ENST00000549279 NEUROD2Q15784 382 aa26.48■■□□□ 1.83
TPCN1-212ENST00000549279 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.48■■□□□ 1.83
TPCN1-212ENST00000549279 NARFQ9UHQ1 456 aa26.48■■□□□ 1.83
TPCN1-212ENST00000549279 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
TPCN1-212ENST00000549279 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
TPCN1-212ENST00000549279 USP16Q9Y5T5 823 aa26.47■■□□□ 1.83
TPCN1-212ENST00000549279 FKBP8Q14318 412 aa26.46■■□□□ 1.83
TPCN1-212ENST00000549279 A1BGP04217 495 aa26.45■■□□□ 1.82
TPCN1-212ENST00000549279 GPR162Q16538 588 aa26.45■■□□□ 1.82
TPCN1-212ENST00000549279 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
TPCN1-212ENST00000549279 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.44■■□□□ 1.82
TPCN1-212ENST00000549279 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
TPCN1-212ENST00000549279 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.43■■□□□ 1.82
TPCN1-212ENST00000549279 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.43■■□□□ 1.82
TPCN1-212ENST00000549279 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
TPCN1-212ENST00000549279 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.42■■□□□ 1.82
TPCN1-212ENST00000549279 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.4■■□□□ 1.82
TPCN1-212ENST00000549279 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
TPCN1-212ENST00000549279 CCDC184Q52MB2 194 aa26.4■■□□□ 1.82
TPCN1-212ENST00000549279 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.39■■□□□ 1.82
TPCN1-212ENST00000549279 TM4SF1P30408 202 aa26.39■■□□□ 1.82
TPCN1-212ENST00000549279 MRS2Q9HD23 443 aa26.39■■□□□ 1.82
TPCN1-212ENST00000549279 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.39■■□□□ 1.82
TPCN1-212ENST00000549279 SCN7AQ01118 1682 aa26.38■■□□□ 1.81
TPCN1-212ENST00000549279 DDR1Q08345 913 aa26.38■■□□□ 1.81
TPCN1-212ENST00000549279 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.38■■□□□ 1.81
TPCN1-212ENST00000549279 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.38■■□□□ 1.81
TPCN1-212ENST00000549279 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
TPCN1-212ENST00000549279 APAF1O14727 1248 aa26.37■■□□□ 1.81
TPCN1-212ENST00000549279 TGFB2P61812 414 aa26.37■■□□□ 1.81
TPCN1-212ENST00000549279 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
TPCN1-212ENST00000549279 NFIXQ14938 502 aa26.36■■□□□ 1.81
TPCN1-212ENST00000549279 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
TPCN1-212ENST00000549279 GRIN3BO60391 1043 aa26.34■■□□□ 1.81
TPCN1-212ENST00000549279 YY1P25490 414 aa26.34■■□□□ 1.81
TPCN1-212ENST00000549279 NBPF26B4DH59 902 aa26.33■■□□□ 1.81
TPCN1-212ENST00000549279 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
TPCN1-212ENST00000549279 NBPF15Q8N660 670 aa26.33■■□□□ 1.81
TPCN1-212ENST00000549279 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
TPCN1-212ENST00000549279 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.33■■□□□ 1.81
TPCN1-212ENST00000549279 CHL1O00533 1208 aa26.32■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 CAMTA2O94983 1202 aa26.32■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.32■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.32■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 BCORQ6W2J9 1755 aa26.32■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 SERPINB2P05120 415 aa26.31■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.31■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.3■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.3■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.3■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 CFAP44Q96MT7 982 aa26.29■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 ERBB4Q15303 1308 aa26.29■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 CHD4Q14839 1912 aa26.28■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 A0A0G2JLW4 131 aa26.28■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.28■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.28■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 RGL2O15211 777 aa26.27■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 DPEP1P16444 411 aa26.27■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 SETDB2Q96T68 719 aa26.27■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.27■■□□□ 1.8
TPCN1-212ENST00000549279 MYL6BP14649 208 aa26.25■■□□□ 1.79
TPCN1-212ENST00000549279 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
TPCN1-212ENST00000549279 NGEFQ8N5V2 710 aa26.24■■□□□ 1.79
TPCN1-212ENST00000549279 IFT57Q9NWB7 429 aa26.24■■□□□ 1.79
TPCN1-212ENST00000549279 GNAI1P63096 354 aa26.23■■□□□ 1.79
TPCN1-212ENST00000549279 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.23■■□□□ 1.79
TPCN1-212ENST00000549279 NPHP1O15259 732 aa26.22■■□□□ 1.79
TPCN1-212ENST00000549279 BCS1LQ9Y276 419 aa26.22■■□□□ 1.79
TPCN1-212ENST00000549279 HOXB7P09629 217 aa26.21■■□□□ 1.79
TPCN1-212ENST00000549279 ZNF853P0CG23 659 aa26.21■■□□□ 1.79
TPCN1-212ENST00000549279 CCDC27Q2M243 656 aa26.21■■□□□ 1.79
TPCN1-212ENST00000549279 MBIPQ9NS73 344 aa26.21■■□□□ 1.79
TPCN1-212ENST00000549279 PIM2Q9P1W9 311 aa26.21■■□□□ 1.79
TPCN1-212ENST00000549279 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
TPCN1-212ENST00000549279 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms