RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 CHD4Q14839 1912 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD8-204ENST00000544999 COL15A1P39059 1388 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD8-204ENST00000544999 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD8-204ENST00000544999 KCNQ3O43525 872 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD8-204ENST00000544999 NFE2L2Q16236 605 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD8-204ENST00000544999 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXD8-204ENST00000544999 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD8-204ENST00000544999 ZPR1O75312 459 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD8-204ENST00000544999 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXD8-204ENST00000544999 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD8-204ENST00000544999 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
HOXD8-204ENST00000544999 FKBP8Q14318 412 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD8-204ENST00000544999 NARFQ9UHQ1 456 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD8-204ENST00000544999 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
HOXD8-204ENST00000544999 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD8-204ENST00000544999 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD8-204ENST00000544999 GRIN3BO60391 1043 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXD8-204ENST00000544999 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
HOXD8-204ENST00000544999 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXD8-204ENST00000544999 A0A087WZG4 1122 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD8-204ENST00000544999 TM4SF1P30408 202 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXD8-204ENST00000544999 TGFB2P61812 414 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXD8-204ENST00000544999 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXD8-204ENST00000544999 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.35■■□□□ 1.17
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HOXD8-204ENST00000544999 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-204ENST00000544999 DDR1Q08345 913 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-204ENST00000544999 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-204ENST00000544999 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD8-204ENST00000544999 A1BGP04217 495 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD8-204ENST00000544999 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
HOXD8-204ENST00000544999 USP16Q9Y5T5 823 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD8-204ENST00000544999 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HOXD8-204ENST00000544999 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXD8-204ENST00000544999 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 RIPK4P57078 832 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 SCN7AQ01118 1682 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 NFIXQ14938 502 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 RUNDC1Q96C34 613 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 A0A0G2JLW4 131 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 DPEP1P16444 411 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 BCORQ6W2J9 1755 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 CAMTA2O94983 1202 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 SERPINB2P05120 415 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 UTRNP46939 3433 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 NBPF26B4DH59 902 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 KCNA3P22001 575 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 NBPF15Q8N660 670 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 BCS1LQ9Y276 419 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 NEUROD2Q15784 382 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 PIM2Q9P1W9 311 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD8-204ENST00000544999 RGL2O15211 777 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD8-204ENST00000544999 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD8-204ENST00000544999 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD8-204ENST00000544999 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD8-204ENST00000544999 CHRNA5P30532 468 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD8-204ENST00000544999 SETDB2Q96T68 719 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD8-204ENST00000544999 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXD8-204ENST00000544999 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.17■■□□□ 1.14
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HOXD8-204ENST00000544999 CHL1O00533 1208 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD8-204ENST00000544999 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD8-204ENST00000544999 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD8-204ENST00000544999 ADCY9O60503 1353 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXD8-204ENST00000544999 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 ANP32CO43423 234 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 CNBD1Q8NA66 436 aa22.13■■□□□ 1.13
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