RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541846.5

LMO3-228, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene LMO3, Length 573 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-228ENST00000541846 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
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LMO3-228ENST00000541846 CHMP4AQ9BY43 222 aa16■□□□□ 0.15
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LMO3-228ENST00000541846 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
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LMO3-228ENST00000541846 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.95■□□□□ 0.14
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LMO3-228ENST00000541846 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.9■□□□□ 0.14
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LMO3-228ENST00000541846 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.89■□□□□ 0.13
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LMO3-228ENST00000541846 RPS6KA4O75676 772 aa15.87■□□□□ 0.13
LMO3-228ENST00000541846 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
LMO3-228ENST00000541846 EIF5P55010 431 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
LMO3-228ENST00000541846 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
LMO3-228ENST00000541846 COPS6Q7L5N1 327 aa15.87■□□□□ 0.13
LMO3-228ENST00000541846 TMEM57Q8N5G2 664 aa15.87■□□□□ 0.13
LMO3-228ENST00000541846 EXOC6Q8TAG9 804 aa15.87■□□□□ 0.13
LMO3-228ENST00000541846 PI4KAP2A4QPH2 592 aa15.85■□□□□ 0.13
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