RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538351.6

ZNF438-208, Transcript of zinc finger protein 438, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF438, Length 3,284 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF438-208	ENST00000538351	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		9.27	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		9.27	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		9.27	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	NBPF4	Q96M43	638 aa		9.27	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		9.27	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	KLHL33	A6NCF5	533 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	TTC36	A6NLP5	189 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	SASH3	O75995	380 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	CP	P00450	1065 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	ELP1	O95163	1332 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	ATP8B1	O43520	1251 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	LIG1	P18858	919 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF75D	P51815	510 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	NEK4	P51957	841 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		9.27	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	NEBL	O76041	1014 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	TBC1D8	O95759	1140 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	GORAB	Q5T7V8	394 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	FIBP	O43427	364 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	SKIL	P12757	684 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	BORCS6	Q96GS4	357 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	ATP10A	O60312	1499 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF428	Q96B54	188 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	ABCC5	O15440	1437 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	ARID5B	Q14865	1188 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	GCC1	Q96CN9	775 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	9.25	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	WDR63	Q8IWG1	891 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	USP8	P40818	1118 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	ITFG2	Q969R8	447 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	GBP6	Q6ZN66	633 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	MIEF2	Q96C03	454 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	VPS18	Q9P253	973 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	INHBE	P58166	350 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	CUL4A	Q13619	759 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	CASC1	Q6TDU7	716 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	CBX8	Q9HC52	389 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351		H3BQF6	201 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	NEMF	O60524	1076 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	ERLIN2	O94905	339 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	MCM2	P49736	904 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	TYRO3	Q06418	890 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC93	Q567U6	631 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		9.22	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		9.22	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		9.22	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	RPS6KA5	O75582	802 aa		9.22	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	PAX7	P23759	505 aa		9.22	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		9.22	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	KAT2B	Q92831	832 aa		9.22	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
ZNF438-208	ENST00000538351	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93

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