RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 PGBD3Q8N328 593 aa8.65□□□□□ -1.02
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CPEB4-210ENST00000522344 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CPEB4-210ENST00000522344 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CPEB4-210ENST00000522344 GPR25O00155 361 aa8.64□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 LGR5O75473 907 aa8.64□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.64□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 HINFPQ9BQA5 517 aa8.64□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.64□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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CPEB4-210ENST00000522344 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.64□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 FAM196BA6NMK8 535 aa8.63□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 DKK1O94907 266 aa8.63□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.63□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.63□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.63□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
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CPEB4-210ENST00000522344 GMCL1Q96IK5 515 aa8.62□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 M0R2N6 131 aa8.61□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 FOXK2Q01167 660 aa8.61□□□□□ -1.03
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CPEB4-210ENST00000522344 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.61□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.61□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
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CPEB4-210ENST00000522344 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.61□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.61□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 NOS2P35228 1153 aa8.6□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 KRT76Q01546 638 aa8.6□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 BICDL1Q6ZP65 573 aa8.6□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.6□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.6□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 SERTM1A2A2V5 107 aa8.59□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 ATP4AP20648 1035 aa8.59□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 TXLNAP40222 546 aa8.59□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 TEAD4Q15561 434 aa8.59□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.59□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.59□□□□□ -1.03
CPEB4-210ENST00000522344 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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CPEB4-210ENST00000522344 THBS1P07996 1170 aa8.58□□□□□ -1.04
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CPEB4-210ENST00000522344 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.58□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 GAS2L2Q8NHY3 880 aa8.58□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.58□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.58□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.58□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 ATAD2Q6PL18 1390 aa8.58□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 ARXQ96QS3 562 aa8.57□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.57□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.57□□□□□ -1.04
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CPEB4-210ENST00000522344 GAS6Q14393 721 aa8.56□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.56□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.56□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 EML1O00423 815 aa8.55□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 C21orf2O43822 256 aa8.55□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 KCNMA1Q12791 1236 aa8.55□□□□□ -1.04
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CPEB4-210ENST00000522344 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.55□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 GSK3AP49840 483 aa8.54□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.54□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.54□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 NGLY1Q96IV0 654 aa8.54□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 ZIC5Q96T25 663 aa8.54□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 MBIPQ9NS73 344 aa8.54□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 PHF24Q9UPV7 400 aa8.54□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 MX2P20592 715 aa8.53□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.53□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 NLRP8Q86W28 1048 aa8.53□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 STK32AQ8WU08 396 aa8.53□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.53□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.53□□□□□ -1.04
CPEB4-210ENST00000522344 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.53□□□□□ -1.04
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CPEB4-210ENST00000522344 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
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CPEB4-210ENST00000522344 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.52□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 ARID3AQ99856 593 aa8.52□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.52□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 BNIP3LO60238 219 aa8.51□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 ATG7O95352 703 aa8.51□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 IGFBP4P22692 258 aa8.51□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.51□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CPEB4-210ENST00000522344 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.51□□□□□ -1.05
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