RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 CITED4Q96RK1 184 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 RECKO95980 971 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 CLN3Q13286 438 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 NBPF15Q8N660 670 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 TMC1Q8TDI8 760 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 EML1O00423 815 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 ALDH1A1P00352 501 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 CBLBQ13191 982 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 ABTB2Q8N961 1025 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 NGLY1Q96IV0 654 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 SERTM1A2A2V5 107 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 ZBTB39O15060 712 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 TEAD4Q15561 434 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM26DQ5JW98 314 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 DSC3Q14574 896 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 PRKD2Q9BZL6 878 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 BCL11AQ9H165 835 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 IGHA2P01877 340 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 DMRTB1Q96MA1 342 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM129BQ96TA1 746 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF232Q9UNY5 417 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 WASF2Q9Y6W5 498 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-205ENST00000514178 BRD2P25440 801 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 NOS2P35228 1153 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 PTGIRP43119 386 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 CENPCQ03188 943 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 SPRYD7Q5W111 196 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 Q6ZVU0 165 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ATCAYQ86WG3 371 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 CABP1Q9NZU7 370 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 USP35Q9P2H5 1018 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR182O15218 404 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 PLCB3Q01970 1234 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 EHHADHQ08426 723 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 L3MBTL2Q969R5 705 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ITPKCQ96DU7 683 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 MEN1O00255 615 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 PDE3BQ13370 1112 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 RTN1Q16799 776 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 AGBL1Q96MI9 1066 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 PARP3Q9Y6F1 533 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 MAPK8P45983 427 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 DGKZQ13574 1117 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF697Q5TEC3 545 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 NLRP3Q96P20 1036 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 LDHBP07195 334 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 C11orf91Q3C1V1 193 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 PHACTR1Q9C0D0 580 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 KLK14Q9P0G3 267 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 POLIQ9UNA4 740 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 RELBQ01201 579 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 FOXC1Q12948 553 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 SPNS2Q8IVW8 549 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFAND3Q9H8U3 227 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 PKD2L1Q9P0L9 805 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 GJD3Q8N144 294 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 BACH2Q9BYV9 841 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 WDR4P57081 412 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 FGD1P98174 961 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 EDEM1Q92611 657 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 IFT43Q96FT9 208 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 ZAP70P43403 619 aa12.31□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 PDGFAP04085 211 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 IFFO2Q5TF58 517 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 RHBDD1Q8TEB9 315 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM161BQ96MY7 647 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 NIF3L1Q9GZT8 377 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 PARP2Q9UGN5 583 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 WWC3Q9ULE0 1092 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 J3QL48 77 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 TIMP2P16035 220 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 USP5P45974 858 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 C1orf53Q5VUE5 145 aa12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms