RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510021.5

UBE2B-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 415 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-207ENST00000510021 TM4SF1P30408 202 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2B-207ENST00000510021 COG3Q96JB2 828 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2B-207ENST00000510021 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
UBE2B-207ENST00000510021 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.86■■□□□ 1.09
UBE2B-207ENST00000510021 DGKZQ13574 1117 aa21.86■■□□□ 1.09
UBE2B-207ENST00000510021 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
UBE2B-207ENST00000510021 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
UBE2B-207ENST00000510021 CAPNS2Q96L46 248 aa21.85■■□□□ 1.09
UBE2B-207ENST00000510021 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2B-207ENST00000510021 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2B-207ENST00000510021 SOX10P56693 466 aa21.83■■□□□ 1.09
UBE2B-207ENST00000510021 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
UBE2B-207ENST00000510021 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
UBE2B-207ENST00000510021 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-207ENST00000510021 INSRP06213 1382 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-207ENST00000510021 ECE1P42892 770 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2B-207ENST00000510021 SPG7Q9UQ90 795 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2B-207ENST00000510021 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-207ENST00000510021 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-207ENST00000510021 CNTROBQ8N137 903 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-207ENST00000510021 NCAPD2Q15021 1401 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-207ENST00000510021 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-207ENST00000510021 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-207ENST00000510021 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-207ENST00000510021 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-207ENST00000510021 CA12O43570 354 aa21.78■■□□□ 1.08
UBE2B-207ENST00000510021 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
UBE2B-207ENST00000510021 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
UBE2B-207ENST00000510021 GRM1Q13255 1194 aa21.77■■□□□ 1.08
UBE2B-207ENST00000510021 H0YIN7 160 aa21.76■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 C21orf2O43822 256 aa21.76■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 PHKG2P15735 406 aa21.76■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.76■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.75■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 MAP2K2P36507 400 aa21.75■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 GCC1Q96CN9 775 aa21.75■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 HACL1Q9UJ83 578 aa21.75■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 AOC2O75106 756 aa21.74■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 NFIXQ14938 502 aa21.74■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.74■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 FLT4P35916 1363 aa21.74■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 EPHX2P34913 555 aa21.73■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.72■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 TJP1Q07157 1748 aa21.72■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.71■■□□□ 1.07
UBE2B-207ENST00000510021 ZPR1O75312 459 aa21.7■■□□□ 1.06
UBE2B-207ENST00000510021 SERPINB2P05120 415 aa21.7■■□□□ 1.06
UBE2B-207ENST00000510021 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
UBE2B-207ENST00000510021 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.7■■□□□ 1.06
UBE2B-207ENST00000510021 TONSLQ96HA7 1378 aa21.7■■□□□ 1.06
UBE2B-207ENST00000510021 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.69■■□□□ 1.06
UBE2B-207ENST00000510021 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.68■■□□□ 1.06
UBE2B-207ENST00000510021 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.67■■□□□ 1.06
UBE2B-207ENST00000510021 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.06
UBE2B-207ENST00000510021 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.67■■□□□ 1.06
UBE2B-207ENST00000510021 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
UBE2B-207ENST00000510021 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.65■■□□□ 1.06
UBE2B-207ENST00000510021 SLX4Q8IY92 1834 aa21.65■■□□□ 1.06
UBE2B-207ENST00000510021 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
UBE2B-207ENST00000510021 CST9Q5W186 159 aa21.64■■□□□ 1.05
UBE2B-207ENST00000510021 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2B-207ENST00000510021 CACNA1SQ13698 1873 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2B-207ENST00000510021 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
UBE2B-207ENST00000510021 NBPF15Q8N660 670 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2B-207ENST00000510021 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
UBE2B-207ENST00000510021 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2B-207ENST00000510021 NARFQ9UHQ1 456 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2B-207ENST00000510021 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2B-207ENST00000510021 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2B-207ENST00000510021 FYB1O15117 783 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2B-207ENST00000510021 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2B-207ENST00000510021 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2B-207ENST00000510021 SOGA3Q5TF21 947 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2B-207ENST00000510021 PDE6BP35913 854 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2B-207ENST00000510021 TRAF5O00463 557 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 EYA1Q99502 592 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 COL15A1P39059 1388 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 CUL9Q8IWT3 2517 aa21.57■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 CABP4P57796 275 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.56■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 CNKSR1Q969H4 720 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 HHIPL1Q96JK4 782 aa21.55■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 DLL1O00548 723 aa21.53■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 GPC2Q8N158 579 aa21.53■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 FZD9O00144 591 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 STYK1Q6J9G0 422 aa21.52■■□□□ 1.04
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