RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 RNFT1Q5M7Z0 435 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 M0R2N6 131 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 THBS1P07996 1170 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 SEC13P55735 322 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 ATP4AP20648 1035 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 PGBD3Q8N328 593 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 GMCL1Q96IK5 515 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 LGR5O75473 907 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 NBPF1Q3BBV0 1214 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 TXLNAP40222 546 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 GAS6Q14393 721 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 ARXQ96QS3 562 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 NOS2P35228 1153 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 TEAD4Q15561 434 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-215ENST00000506510 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 EFHC2Q5JST6 749 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 HINFPQ9BQA5 517 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 SERTM1A2A2V5 107 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 EML1O00423 815 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 C21orf2O43822 256 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 CHMP3Q9Y3E7 222 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 A0A1W2PNR3 127 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 GAS2L2Q8NHY3 880 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.43□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 ZIC5Q96T25 663 aa9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 MBIPQ9NS73 344 aa9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.42□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 STK32AQ8WU08 396 aa9.41□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 PBXIP1Q96AQ6 731 aa9.41□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 ABHD17AQ96GS6 310 aa9.41□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.41□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 ADAMTS2O95450 1211 aa9.4□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 POTEAQ6S8J7 498 aa9.4□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 KLRG1Q96E93 195 aa9.4□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PDE4D-215ENST00000506510 BNIP3LO60238 219 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 MX2P20592 715 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 FIGNL1Q6PIW4 674 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 NLRP8Q86W28 1048 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 RHPN1Q8TCX5 695 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 PHF24Q9UPV7 400 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.39□□□□□ -0.91
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PDE4D-215ENST00000506510 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 ATG7O95352 703 aa9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 SLURP2P0DP57 97 aa9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 IGFBP4P22692 258 aa9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 ERICH6Q7L0X2 663 aa9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 WHAMMQ8TF30 809 aa9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 NGLY1Q96IV0 654 aa9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.37□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 STK17AQ9UEE5 414 aa9.37□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-215ENST00000506510 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
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