RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 COX20Q5RI15 118 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 TNS4Q8IZW8 715 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 GJD3Q8N144 294 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 ABTB2Q8N961 1025 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 BACH1O14867 736 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 APLP1P51693 650 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 ANAPC15P60006 121 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 CCDC181Q5TID7 509 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
STRADB-210ENST00000498648 A0A1W2PRU2 124 aa6.83□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.83□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 SCNN1DP51172 638 aa6.83□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.83□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 SPSB2Q99619 263 aa6.83□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.83□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 POLIQ9UNA4 740 aa6.83□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 ENPP3O14638 875 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 SCTRP47872 440 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 GDF10P55107 478 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 SERINC3Q13530 473 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 ATCAYQ86WG3 371 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 FOXJ1Q92949 421 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 NBPF4Q96M43 638 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 CSRNP1Q96S65 589 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 ZBTB39O15060 712 aa6.81□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 USP5P45974 858 aa6.81□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 AGERQ15109 404 aa6.81□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 FAM26DQ5JW98 314 aa6.81□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 MYO19Q96H55 970 aa6.81□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.81□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 GGT7Q9UJ14 662 aa6.81□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.81□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 SPG7Q9UQ90 795 aa6.81□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 FOXK2Q01167 660 aa6.8□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 PAK2Q13177 524 aa6.8□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.8□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 MKL1Q969V6 931 aa6.8□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 USP31Q70CQ4 1352 aa6.8□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa6.79□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 PDGFAP04085 211 aa6.79□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 INHAP05111 366 aa6.79□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 PPP4CP60510 307 aa6.79□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 ERVK-9P63128 1117 aa6.79□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.79□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.79□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 ZNF511Q8NB15 262 aa6.79□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 BAP1Q92560 729 aa6.79□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 GPRASP2Q96D09 838 aa6.79□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.79□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 IFT57Q9NWB7 429 aa6.79□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.79□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 POTEJP0CG39 1038 aa6.78□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 ORC1Q13415 861 aa6.78□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 LINC01559Q495D7 138 aa6.78□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.78□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 EDEM1Q92611 657 aa6.78□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.78□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 PSMD1Q99460 953 aa6.78□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.78□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.78□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.78□□□□□ -1.32
STRADB-210ENST00000498648 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 OPLAHO14841 1288 aa6.77□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 PBX2P40425 430 aa6.77□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 RAB15P59190 212 aa6.77□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.77□□□□□ -1.33
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