RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-231ENST00000496246 SMIM5Q71RC9 77 aa14.87□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 RUNDC1Q96C34 613 aa14.87□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.87□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.87□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 COL15A1P39059 1388 aa14.86□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 TJP1Q07157 1748 aa14.86□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 NPHP1O15259 732 aa14.86□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 GYS1P13807 737 aa14.86□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.86□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 NARFQ9UHQ1 456 aa14.86□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.86□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 NEUROD2Q15784 382 aa14.85□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 UBR2Q8IWV8 1755 aa14.85□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 TGFB2P61812 414 aa14.84□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 USPL1Q5W0Q7 1092 aa14.84□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 CCDC146Q8IYE0 955 aa14.84□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.84□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.84□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.84□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 TMPOP42166 694 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.83□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 ADAMTS8Q9UP79 889 aa14.82□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 KCNQ3O43525 872 aa14.81□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 FKBP8Q14318 412 aa14.81□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.81□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 A1BGP04217 495 aa14.8□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.8□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 C4AP0C0L4 1744 aa14.8□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 SETDB2Q96T68 719 aa14.79□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.79□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 USP16Q9Y5T5 823 aa14.79□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.78□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.78□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.78□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 MRS2Q9HD23 443 aa14.78□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.78□□□□□ -0.04
TTLL3-231ENST00000496246 SERPINB2P05120 415 aa14.77□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 PIM2Q9P1W9 311 aa14.77□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 CHD4Q14839 1912 aa14.76□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 ERBB4Q15303 1308 aa14.76□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 TM4SF1P30408 202 aa14.76□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 ST5P78524 1137 aa14.76□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 NFIXQ14938 502 aa14.76□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.76□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 BCS1LQ9Y276 419 aa14.76□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.75□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.75□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 RGL2O15211 777 aa14.75□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 A0A0G2JLW4 131 aa14.74□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 H0YIN7 160 aa14.74□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 DPEP1P16444 411 aa14.74□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 PDE6BP35913 854 aa14.74□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 DDR1Q08345 913 aa14.74□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 NGEFQ8N5V2 710 aa14.74□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 CNBD1Q8NA66 436 aa14.74□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.73□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 APAF1O14727 1248 aa14.73□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 GNAI1P63096 354 aa14.73□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.73□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.73□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 MYL6BP14649 208 aa14.72□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.72□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.72□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 CFAP44Q96MT7 982 aa14.72□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.72□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 CAMTA2O94983 1202 aa14.71□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.71□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 NYXQ9GZU5 481 aa14.71□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
TTLL3-231ENST00000496246 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.71□□□□□ -0.06
TTLL3-231ENST00000496246 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.7□□□□□ -0.06
TTLL3-231ENST00000496246 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.7□□□□□ -0.06
TTLL3-231ENST00000496246 CHL1O00533 1208 aa14.7□□□□□ -0.06
TTLL3-231ENST00000496246 HOXB7P09629 217 aa14.7□□□□□ -0.06
TTLL3-231ENST00000496246 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.7□□□□□ -0.06
TTLL3-231ENST00000496246 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.7□□□□□ -0.06
TTLL3-231ENST00000496246 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.7□□□□□ -0.06
TTLL3-231ENST00000496246 IFT57Q9NWB7 429 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.4 ms