RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494396.5

SYP-208, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 2,062 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-208ENST00000494396 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.28■□□□□ 0.84
SYP-208ENST00000494396 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.28■□□□□ 0.84
SYP-208ENST00000494396 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.28■□□□□ 0.84
SYP-208ENST00000494396 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.27■□□□□ 0.84
SYP-208ENST00000494396 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.27■□□□□ 0.84
SYP-208ENST00000494396 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
SYP-208ENST00000494396 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.26■□□□□ 0.83
SYP-208ENST00000494396 RGS12O14924 1447 aa20.24■□□□□ 0.83
SYP-208ENST00000494396 MCTP1Q6DN14 999 aa20.24■□□□□ 0.83
SYP-208ENST00000494396 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SYP-208ENST00000494396 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.23■□□□□ 0.83
SYP-208ENST00000494396 ST18O60284 1047 aa20.23■□□□□ 0.83
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SYP-208ENST00000494396 LGR6Q9HBX8 967 aa20.23■□□□□ 0.83
SYP-208ENST00000494396 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SYP-208ENST00000494396 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.23■□□□□ 0.83
SYP-208ENST00000494396 MBD3O95983 291 aa20.23■□□□□ 0.83
SYP-208ENST00000494396 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SYP-208ENST00000494396 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
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SYP-208ENST00000494396 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.23■□□□□ 0.83
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SYP-208ENST00000494396 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
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SYP-208ENST00000494396 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.22■□□□□ 0.83
SYP-208ENST00000494396 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.22■□□□□ 0.83
SYP-208ENST00000494396 CASC1Q6TDU7 716 aa20.22■□□□□ 0.83
SYP-208ENST00000494396 ABCA3Q99758 1704 aa20.21■□□□□ 0.83
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SYP-208ENST00000494396 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
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SYP-208ENST00000494396 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.2■□□□□ 0.82
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SYP-208ENST00000494396 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.19■□□□□ 0.82
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SYP-208ENST00000494396 STK31Q9BXU1 1019 aa20.17■□□□□ 0.82
SYP-208ENST00000494396 PRDM4Q9UKN5 801 aa20.17■□□□□ 0.82
SYP-208ENST00000494396 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SYP-208ENST00000494396 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.17■□□□□ 0.82
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SYP-208ENST00000494396 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SYP-208ENST00000494396 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.14■□□□□ 0.81
SYP-208ENST00000494396 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.14■□□□□ 0.81
SYP-208ENST00000494396 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SYP-208ENST00000494396 G2E3Q7L622 706 aa20.14■□□□□ 0.81
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SYP-208ENST00000494396 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.14■□□□□ 0.81
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SYP-208ENST00000494396 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
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SYP-208ENST00000494396 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.11■□□□□ 0.81
SYP-208ENST00000494396 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
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SYP-208ENST00000494396 DCAF5Q96JK2 942 aa20.09■□□□□ 0.81
SYP-208ENST00000494396 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SYP-208ENST00000494396 CYP27B1O15528 508 aa20.09■□□□□ 0.81
SYP-208ENST00000494396 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SYP-208ENST00000494396 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SYP-208ENST00000494396 FLIIQ13045 1269 aa20.08■□□□□ 0.81
SYP-208ENST00000494396 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SYP-208ENST00000494396 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.08■□□□□ 0.81
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